Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUZ7

Sh3bgr, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrQ9WUZ7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sh3bgrQ9WUZ7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sh3bgrQ9WUZ7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sh3bgrQ9WUZ7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Sh3bgrQ9WUZ7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sh3bgrQ9WUZ7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sh3bgrQ9WUZ7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sh3bgrQ9WUZ7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Sh3bgrQ9WUZ7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Sh3bgrQ9WUZ7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Sh3bgrQ9WUZ7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Sh3bgrQ9WUZ7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Sh3bgrQ9WUZ7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Sh3bgrQ9WUZ7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sh3bgrQ9WUZ7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sh3bgrQ9WUZ7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sh3bgrQ9WUZ7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sh3bgrQ9WUZ7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sh3bgrQ9WUZ7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sh3bgrQ9WUZ7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sh3bgrQ9WUZ7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Sh3bgrQ9WUZ7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sh3bgrQ9WUZ7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sh3bgrQ9WUZ7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sh3bgrQ9WUZ7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sh3bgrQ9WUZ7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sh3bgrQ9WUZ7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sh3bgrQ9WUZ7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sh3bgrQ9WUZ7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms