Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp18Q9WTV6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp18Q9WTV6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp18Q9WTV6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp18Q9WTV6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp18Q9WTV6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp18Q9WTV6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp18Q9WTV6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp18Q9WTV6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp18Q9WTV6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp18Q9WTV6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp18Q9WTV6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp18Q9WTV6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp18Q9WTV6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp18Q9WTV6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp18Q9WTV6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp18Q9WTV6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp18Q9WTV6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Usp18Q9WTV6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Usp18Q9WTV6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp18Q9WTV6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp18Q9WTV6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp18Q9WTV6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp18Q9WTV6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp18Q9WTV6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp18Q9WTV6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp18Q9WTV6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp18Q9WTV6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp18Q9WTV6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp18Q9WTV6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Usp18Q9WTV6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Usp18Q9WTV6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp18Q9WTV6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp18Q9WTV6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp18Q9WTV6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp18Q9WTV6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp18Q9WTV6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp18Q9WTV6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp18Q9WTV6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp18Q9WTV6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp18Q9WTV6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp18Q9WTV6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp18Q9WTV6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp18Q9WTV6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp18Q9WTV6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp18Q9WTV6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp18Q9WTV6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp18Q9WTV6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp18Q9WTV6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp18Q9WTV6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp18Q9WTV6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp18Q9WTV6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp18Q9WTV6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp18Q9WTV6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp18Q9WTV6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp18Q9WTV6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp18Q9WTV6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp18Q9WTV6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp18Q9WTV6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp18Q9WTV6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp18Q9WTV6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp18Q9WTV6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp18Q9WTV6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp18Q9WTV6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp18Q9WTV6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp18Q9WTV6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp18Q9WTV6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp18Q9WTV6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp18Q9WTV6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp18Q9WTV6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp18Q9WTV6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp18Q9WTV6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Usp18Q9WTV6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp18Q9WTV6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp18Q9WTV6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp18Q9WTV6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp18Q9WTV6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp18Q9WTV6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp18Q9WTV6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp18Q9WTV6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp18Q9WTV6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp18Q9WTV6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp18Q9WTV6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp18Q9WTV6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp18Q9WTV6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp18Q9WTV6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp18Q9WTV6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp18Q9WTV6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp18Q9WTV6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp18Q9WTV6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp18Q9WTV6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp18Q9WTV6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Usp18Q9WTV6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp18Q9WTV6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp18Q9WTV6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp18Q9WTV6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp18Q9WTV6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp18Q9WTV6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp18Q9WTV6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp18Q9WTV6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms