Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQM7

CAMK2A, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2AQ9UQM7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAMK2AQ9UQM7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAMK2AQ9UQM7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAMK2AQ9UQM7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAMK2AQ9UQM7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAMK2AQ9UQM7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAMK2AQ9UQM7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAMK2AQ9UQM7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAMK2AQ9UQM7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAMK2AQ9UQM7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAMK2AQ9UQM7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAMK2AQ9UQM7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAMK2AQ9UQM7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAMK2AQ9UQM7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAMK2AQ9UQM7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAMK2AQ9UQM7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAMK2AQ9UQM7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CAMK2AQ9UQM7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAMK2AQ9UQM7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CAMK2AQ9UQM7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAMK2AQ9UQM7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAMK2AQ9UQM7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAMK2AQ9UQM7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAMK2AQ9UQM7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAMK2AQ9UQM7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CAMK2AQ9UQM7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CAMK2AQ9UQM7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAMK2AQ9UQM7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAMK2AQ9UQM7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAMK2AQ9UQM7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAMK2AQ9UQM7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAMK2AQ9UQM7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAMK2AQ9UQM7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAMK2AQ9UQM7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAMK2AQ9UQM7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAMK2AQ9UQM7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAMK2AQ9UQM7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAMK2AQ9UQM7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAMK2AQ9UQM7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAMK2AQ9UQM7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAMK2AQ9UQM7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAMK2AQ9UQM7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAMK2AQ9UQM7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAMK2AQ9UQM7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAMK2AQ9UQM7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAMK2AQ9UQM7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAMK2AQ9UQM7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAMK2AQ9UQM7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAMK2AQ9UQM7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAMK2AQ9UQM7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAMK2AQ9UQM7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAMK2AQ9UQM7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAMK2AQ9UQM7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAMK2AQ9UQM7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAMK2AQ9UQM7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAMK2AQ9UQM7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAMK2AQ9UQM7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAMK2AQ9UQM7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAMK2AQ9UQM7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAMK2AQ9UQM7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAMK2AQ9UQM7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAMK2AQ9UQM7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAMK2AQ9UQM7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAMK2AQ9UQM7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
CAMK2AQ9UQM7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAMK2AQ9UQM7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAMK2AQ9UQM7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAMK2AQ9UQM7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAMK2AQ9UQM7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAMK2AQ9UQM7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAMK2AQ9UQM7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAMK2AQ9UQM7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAMK2AQ9UQM7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAMK2AQ9UQM7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAMK2AQ9UQM7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAMK2AQ9UQM7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAMK2AQ9UQM7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAMK2AQ9UQM7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAMK2AQ9UQM7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAMK2AQ9UQM7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAMK2AQ9UQM7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAMK2AQ9UQM7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAMK2AQ9UQM7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAMK2AQ9UQM7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAMK2AQ9UQM7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAMK2AQ9UQM7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAMK2AQ9UQM7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CAMK2AQ9UQM7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAMK2AQ9UQM7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAMK2AQ9UQM7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CAMK2AQ9UQM7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAMK2AQ9UQM7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAMK2AQ9UQM7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CAMK2AQ9UQM7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAMK2AQ9UQM7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAMK2AQ9UQM7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAMK2AQ9UQM7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAMK2AQ9UQM7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAMK2AQ9UQM7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAMK2AQ9UQM7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms