Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW6

SATB2, DNA-binding protein SATB2, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB2Q9UPW6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SATB2Q9UPW6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SATB2Q9UPW6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SATB2Q9UPW6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SATB2Q9UPW6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SATB2Q9UPW6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SATB2Q9UPW6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SATB2Q9UPW6 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SATB2Q9UPW6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SATB2Q9UPW6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SATB2Q9UPW6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SATB2Q9UPW6 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SATB2Q9UPW6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SATB2Q9UPW6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SATB2Q9UPW6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SATB2Q9UPW6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SATB2Q9UPW6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SATB2Q9UPW6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SATB2Q9UPW6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SATB2Q9UPW6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SATB2Q9UPW6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SATB2Q9UPW6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SATB2Q9UPW6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SATB2Q9UPW6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SATB2Q9UPW6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SATB2Q9UPW6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SATB2Q9UPW6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SATB2Q9UPW6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SATB2Q9UPW6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SATB2Q9UPW6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SATB2Q9UPW6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SATB2Q9UPW6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SATB2Q9UPW6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SATB2Q9UPW6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SATB2Q9UPW6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SATB2Q9UPW6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SATB2Q9UPW6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SATB2Q9UPW6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SATB2Q9UPW6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SATB2Q9UPW6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SATB2Q9UPW6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SATB2Q9UPW6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SATB2Q9UPW6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SATB2Q9UPW6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SATB2Q9UPW6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SATB2Q9UPW6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SATB2Q9UPW6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SATB2Q9UPW6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SATB2Q9UPW6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SATB2Q9UPW6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SATB2Q9UPW6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SATB2Q9UPW6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SATB2Q9UPW6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SATB2Q9UPW6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SATB2Q9UPW6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SATB2Q9UPW6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SATB2Q9UPW6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SATB2Q9UPW6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SATB2Q9UPW6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SATB2Q9UPW6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SATB2Q9UPW6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SATB2Q9UPW6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SATB2Q9UPW6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SATB2Q9UPW6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SATB2Q9UPW6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SATB2Q9UPW6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SATB2Q9UPW6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SATB2Q9UPW6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SATB2Q9UPW6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SATB2Q9UPW6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SATB2Q9UPW6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SATB2Q9UPW6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SATB2Q9UPW6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SATB2Q9UPW6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SATB2Q9UPW6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SATB2Q9UPW6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SATB2Q9UPW6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SATB2Q9UPW6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SATB2Q9UPW6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SATB2Q9UPW6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SATB2Q9UPW6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SATB2Q9UPW6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SATB2Q9UPW6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SATB2Q9UPW6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SATB2Q9UPW6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SATB2Q9UPW6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SATB2Q9UPW6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SATB2Q9UPW6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SATB2Q9UPW6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SATB2Q9UPW6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SATB2Q9UPW6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SATB2Q9UPW6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SATB2Q9UPW6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SATB2Q9UPW6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SATB2Q9UPW6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SATB2Q9UPW6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SATB2Q9UPW6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SATB2Q9UPW6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SATB2Q9UPW6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SATB2Q9UPW6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms