Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNX6Q9UNH7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNX6Q9UNH7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX6Q9UNH7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX6Q9UNH7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX6Q9UNH7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX6Q9UNH7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX6Q9UNH7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX6Q9UNH7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SNX6Q9UNH7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SNX6Q9UNH7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNX6Q9UNH7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNX6Q9UNH7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX6Q9UNH7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX6Q9UNH7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX6Q9UNH7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX6Q9UNH7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SNX6Q9UNH7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SNX6Q9UNH7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SNX6Q9UNH7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX6Q9UNH7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNX6Q9UNH7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNX6Q9UNH7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNX6Q9UNH7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX6Q9UNH7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX6Q9UNH7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX6Q9UNH7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX6Q9UNH7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX6Q9UNH7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX6Q9UNH7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX6Q9UNH7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX6Q9UNH7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX6Q9UNH7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX6Q9UNH7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX6Q9UNH7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNX6Q9UNH7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SNX6Q9UNH7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX6Q9UNH7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX6Q9UNH7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX6Q9UNH7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX6Q9UNH7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX6Q9UNH7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNX6Q9UNH7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNX6Q9UNH7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNX6Q9UNH7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNX6Q9UNH7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNX6Q9UNH7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNX6Q9UNH7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX6Q9UNH7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX6Q9UNH7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX6Q9UNH7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX6Q9UNH7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX6Q9UNH7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX6Q9UNH7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX6Q9UNH7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX6Q9UNH7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX6Q9UNH7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX6Q9UNH7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNX6Q9UNH7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNX6Q9UNH7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX6Q9UNH7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX6Q9UNH7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX6Q9UNH7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNX6Q9UNH7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNX6Q9UNH7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNX6Q9UNH7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNX6Q9UNH7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNX6Q9UNH7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNX6Q9UNH7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNX6Q9UNH7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX6Q9UNH7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX6Q9UNH7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX6Q9UNH7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX6Q9UNH7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX6Q9UNH7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX6Q9UNH7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNX6Q9UNH7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNX6Q9UNH7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX6Q9UNH7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNX6Q9UNH7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNX6Q9UNH7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNX6Q9UNH7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNX6Q9UNH7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNX6Q9UNH7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SNX6Q9UNH7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNX6Q9UNH7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNX6Q9UNH7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNX6Q9UNH7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SNX6Q9UNH7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SNX6Q9UNH7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SNX6Q9UNH7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SNX6Q9UNH7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SNX6Q9UNH7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNX6Q9UNH7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNX6Q9UNH7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNX6Q9UNH7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX6Q9UNH7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX6Q9UNH7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX6Q9UNH7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX6Q9UNH7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88 ms