Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR7

CLEC4A, C-type lectin domain family 4 member A, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4AQ9UMR7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLEC4AQ9UMR7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLEC4AQ9UMR7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLEC4AQ9UMR7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLEC4AQ9UMR7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLEC4AQ9UMR7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLEC4AQ9UMR7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLEC4AQ9UMR7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLEC4AQ9UMR7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLEC4AQ9UMR7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLEC4AQ9UMR7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLEC4AQ9UMR7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLEC4AQ9UMR7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLEC4AQ9UMR7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLEC4AQ9UMR7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLEC4AQ9UMR7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLEC4AQ9UMR7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CLEC4AQ9UMR7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLEC4AQ9UMR7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CLEC4AQ9UMR7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLEC4AQ9UMR7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLEC4AQ9UMR7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CLEC4AQ9UMR7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLEC4AQ9UMR7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLEC4AQ9UMR7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CLEC4AQ9UMR7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLEC4AQ9UMR7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLEC4AQ9UMR7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLEC4AQ9UMR7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLEC4AQ9UMR7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLEC4AQ9UMR7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLEC4AQ9UMR7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLEC4AQ9UMR7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLEC4AQ9UMR7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLEC4AQ9UMR7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CLEC4AQ9UMR7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLEC4AQ9UMR7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CLEC4AQ9UMR7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLEC4AQ9UMR7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLEC4AQ9UMR7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLEC4AQ9UMR7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLEC4AQ9UMR7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLEC4AQ9UMR7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLEC4AQ9UMR7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLEC4AQ9UMR7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLEC4AQ9UMR7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLEC4AQ9UMR7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLEC4AQ9UMR7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLEC4AQ9UMR7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLEC4AQ9UMR7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLEC4AQ9UMR7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLEC4AQ9UMR7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLEC4AQ9UMR7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLEC4AQ9UMR7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLEC4AQ9UMR7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLEC4AQ9UMR7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLEC4AQ9UMR7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLEC4AQ9UMR7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLEC4AQ9UMR7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLEC4AQ9UMR7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLEC4AQ9UMR7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CLEC4AQ9UMR7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CLEC4AQ9UMR7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLEC4AQ9UMR7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLEC4AQ9UMR7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLEC4AQ9UMR7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLEC4AQ9UMR7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLEC4AQ9UMR7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CLEC4AQ9UMR7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLEC4AQ9UMR7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLEC4AQ9UMR7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLEC4AQ9UMR7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLEC4AQ9UMR7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CLEC4AQ9UMR7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLEC4AQ9UMR7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLEC4AQ9UMR7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLEC4AQ9UMR7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLEC4AQ9UMR7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLEC4AQ9UMR7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLEC4AQ9UMR7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLEC4AQ9UMR7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CLEC4AQ9UMR7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CLEC4AQ9UMR7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLEC4AQ9UMR7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLEC4AQ9UMR7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLEC4AQ9UMR7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLEC4AQ9UMR7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLEC4AQ9UMR7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLEC4AQ9UMR7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLEC4AQ9UMR7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLEC4AQ9UMR7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLEC4AQ9UMR7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CLEC4AQ9UMR7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLEC4AQ9UMR7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLEC4AQ9UMR7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLEC4AQ9UMR7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLEC4AQ9UMR7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLEC4AQ9UMR7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CLEC4AQ9UMR7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CLEC4AQ9UMR7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms