Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULU4

ZMYND8, Protein kinase C-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZMYND8Q9ULU4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ZMYND8Q9ULU4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ZMYND8Q9ULU4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ZMYND8Q9ULU4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ZMYND8Q9ULU4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ZMYND8Q9ULU4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ZMYND8Q9ULU4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ZMYND8Q9ULU4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
ZMYND8Q9ULU4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
ZMYND8Q9ULU4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ZMYND8Q9ULU4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ZMYND8Q9ULU4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ZMYND8Q9ULU4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ZMYND8Q9ULU4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ZMYND8Q9ULU4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ZMYND8Q9ULU4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ZMYND8Q9ULU4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
ZMYND8Q9ULU4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ZMYND8Q9ULU4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ZMYND8Q9ULU4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ZMYND8Q9ULU4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ZMYND8Q9ULU4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
ZMYND8Q9ULU4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ZMYND8Q9ULU4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ZMYND8Q9ULU4 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ZMYND8Q9ULU4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ZMYND8Q9ULU4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ZMYND8Q9ULU4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ZMYND8Q9ULU4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ZMYND8Q9ULU4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ZMYND8Q9ULU4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ZMYND8Q9ULU4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ZMYND8Q9ULU4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ZMYND8Q9ULU4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ZMYND8Q9ULU4 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
ZMYND8Q9ULU4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
ZMYND8Q9ULU4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ZMYND8Q9ULU4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ZMYND8Q9ULU4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ZMYND8Q9ULU4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ZMYND8Q9ULU4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ZMYND8Q9ULU4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ZMYND8Q9ULU4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ZMYND8Q9ULU4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ZMYND8Q9ULU4 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ZMYND8Q9ULU4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
ZMYND8Q9ULU4 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ZMYND8Q9ULU4 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ZMYND8Q9ULU4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ZMYND8Q9ULU4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ZMYND8Q9ULU4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ZMYND8Q9ULU4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ZMYND8Q9ULU4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ZMYND8Q9ULU4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
ZMYND8Q9ULU4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ZMYND8Q9ULU4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ZMYND8Q9ULU4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ZMYND8Q9ULU4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ZMYND8Q9ULU4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ZMYND8Q9ULU4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ZMYND8Q9ULU4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ZMYND8Q9ULU4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ZMYND8Q9ULU4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ZMYND8Q9ULU4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ZMYND8Q9ULU4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ZMYND8Q9ULU4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ZMYND8Q9ULU4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ZMYND8Q9ULU4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ZMYND8Q9ULU4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ZMYND8Q9ULU4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ZMYND8Q9ULU4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ZMYND8Q9ULU4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ZMYND8Q9ULU4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ZMYND8Q9ULU4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ZMYND8Q9ULU4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ZMYND8Q9ULU4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
ZMYND8Q9ULU4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
ZMYND8Q9ULU4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ZMYND8Q9ULU4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
ZMYND8Q9ULU4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
ZMYND8Q9ULU4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
ZMYND8Q9ULU4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
ZMYND8Q9ULU4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
ZMYND8Q9ULU4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
ZMYND8Q9ULU4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
ZMYND8Q9ULU4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ZMYND8Q9ULU4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ZMYND8Q9ULU4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ZMYND8Q9ULU4 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ZMYND8Q9ULU4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ZMYND8Q9ULU4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
ZMYND8Q9ULU4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
ZMYND8Q9ULU4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
ZMYND8Q9ULU4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ZMYND8Q9ULU4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ZMYND8Q9ULU4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ZMYND8Q9ULU4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ZMYND8Q9ULU4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ZMYND8Q9ULU4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ZMYND8Q9ULU4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.7 ms