Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULM2

ZNF490, Zinc finger protein 490, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF490Q9ULM2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF490Q9ULM2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF490Q9ULM2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF490Q9ULM2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF490Q9ULM2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNF490Q9ULM2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNF490Q9ULM2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNF490Q9ULM2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF490Q9ULM2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF490Q9ULM2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF490Q9ULM2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF490Q9ULM2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF490Q9ULM2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF490Q9ULM2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF490Q9ULM2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF490Q9ULM2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF490Q9ULM2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF490Q9ULM2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF490Q9ULM2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF490Q9ULM2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF490Q9ULM2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF490Q9ULM2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF490Q9ULM2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF490Q9ULM2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF490Q9ULM2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF490Q9ULM2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF490Q9ULM2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF490Q9ULM2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF490Q9ULM2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF490Q9ULM2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF490Q9ULM2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF490Q9ULM2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF490Q9ULM2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF490Q9ULM2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF490Q9ULM2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF490Q9ULM2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF490Q9ULM2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF490Q9ULM2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF490Q9ULM2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ZNF490Q9ULM2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ZNF490Q9ULM2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF490Q9ULM2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF490Q9ULM2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF490Q9ULM2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF490Q9ULM2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF490Q9ULM2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF490Q9ULM2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF490Q9ULM2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF490Q9ULM2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF490Q9ULM2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF490Q9ULM2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF490Q9ULM2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF490Q9ULM2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF490Q9ULM2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF490Q9ULM2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF490Q9ULM2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF490Q9ULM2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF490Q9ULM2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF490Q9ULM2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF490Q9ULM2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF490Q9ULM2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZNF490Q9ULM2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF490Q9ULM2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF490Q9ULM2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF490Q9ULM2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF490Q9ULM2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNF490Q9ULM2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNF490Q9ULM2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNF490Q9ULM2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNF490Q9ULM2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF490Q9ULM2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF490Q9ULM2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF490Q9ULM2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF490Q9ULM2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF490Q9ULM2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF490Q9ULM2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF490Q9ULM2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF490Q9ULM2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF490Q9ULM2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF490Q9ULM2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF490Q9ULM2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF490Q9ULM2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF490Q9ULM2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF490Q9ULM2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF490Q9ULM2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF490Q9ULM2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF490Q9ULM2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF490Q9ULM2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF490Q9ULM2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF490Q9ULM2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF490Q9ULM2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF490Q9ULM2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF490Q9ULM2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF490Q9ULM2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF490Q9ULM2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF490Q9ULM2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF490Q9ULM2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF490Q9ULM2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF490Q9ULM2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF490Q9ULM2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms