Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE6

PALD1, Paladin, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALD1Q9ULE6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PALD1Q9ULE6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PALD1Q9ULE6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
PALD1Q9ULE6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
PALD1Q9ULE6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC32.51■■■□□ 2.8
PALD1Q9ULE6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
PALD1Q9ULE6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
PALD1Q9ULE6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
PALD1Q9ULE6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
PALD1Q9ULE6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
PALD1Q9ULE6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
PALD1Q9ULE6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
PALD1Q9ULE6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
PALD1Q9ULE6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
PALD1Q9ULE6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
PALD1Q9ULE6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC32.42■■■□□ 2.78
PALD1Q9ULE6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
PALD1Q9ULE6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
PALD1Q9ULE6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PALD1Q9ULE6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PALD1Q9ULE6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PALD1Q9ULE6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PALD1Q9ULE6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
PALD1Q9ULE6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
PALD1Q9ULE6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
PALD1Q9ULE6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
PALD1Q9ULE6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
PALD1Q9ULE6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PALD1Q9ULE6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PALD1Q9ULE6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
PALD1Q9ULE6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
PALD1Q9ULE6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
PALD1Q9ULE6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PALD1Q9ULE6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
PALD1Q9ULE6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PALD1Q9ULE6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PALD1Q9ULE6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PALD1Q9ULE6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PALD1Q9ULE6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
PALD1Q9ULE6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
PALD1Q9ULE6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
PALD1Q9ULE6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
PALD1Q9ULE6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PALD1Q9ULE6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PALD1Q9ULE6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PALD1Q9ULE6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PALD1Q9ULE6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PALD1Q9ULE6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
PALD1Q9ULE6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
PALD1Q9ULE6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PALD1Q9ULE6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
PALD1Q9ULE6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PALD1Q9ULE6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PALD1Q9ULE6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PALD1Q9ULE6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PALD1Q9ULE6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PALD1Q9ULE6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PALD1Q9ULE6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PALD1Q9ULE6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PALD1Q9ULE6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PALD1Q9ULE6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
PALD1Q9ULE6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PALD1Q9ULE6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PALD1Q9ULE6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
PALD1Q9ULE6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
PALD1Q9ULE6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PALD1Q9ULE6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PALD1Q9ULE6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PALD1Q9ULE6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PALD1Q9ULE6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PALD1Q9ULE6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PALD1Q9ULE6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PALD1Q9ULE6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PALD1Q9ULE6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PALD1Q9ULE6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PALD1Q9ULE6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PALD1Q9ULE6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PALD1Q9ULE6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PALD1Q9ULE6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PALD1Q9ULE6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PALD1Q9ULE6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.73
PALD1Q9ULE6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PALD1Q9ULE6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PALD1Q9ULE6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PALD1Q9ULE6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PALD1Q9ULE6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PALD1Q9ULE6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PALD1Q9ULE6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PALD1Q9ULE6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PALD1Q9ULE6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PALD1Q9ULE6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PALD1Q9ULE6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
PALD1Q9ULE6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PALD1Q9ULE6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PALD1Q9ULE6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PALD1Q9ULE6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PALD1Q9ULE6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PALD1Q9ULE6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PALD1Q9ULE6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
PALD1Q9ULE6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms