Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB5

CDH7, Cadherin-7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH7Q9ULB5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDH7Q9ULB5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CDH7Q9ULB5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CDH7Q9ULB5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDH7Q9ULB5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDH7Q9ULB5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDH7Q9ULB5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CDH7Q9ULB5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDH7Q9ULB5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDH7Q9ULB5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDH7Q9ULB5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDH7Q9ULB5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDH7Q9ULB5 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDH7Q9ULB5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDH7Q9ULB5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CDH7Q9ULB5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDH7Q9ULB5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDH7Q9ULB5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDH7Q9ULB5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDH7Q9ULB5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDH7Q9ULB5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDH7Q9ULB5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDH7Q9ULB5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDH7Q9ULB5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDH7Q9ULB5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDH7Q9ULB5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CDH7Q9ULB5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDH7Q9ULB5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CDH7Q9ULB5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDH7Q9ULB5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDH7Q9ULB5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDH7Q9ULB5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDH7Q9ULB5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CDH7Q9ULB5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDH7Q9ULB5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDH7Q9ULB5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDH7Q9ULB5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDH7Q9ULB5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CDH7Q9ULB5 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDH7Q9ULB5 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDH7Q9ULB5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CDH7Q9ULB5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CDH7Q9ULB5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CDH7Q9ULB5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDH7Q9ULB5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDH7Q9ULB5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDH7Q9ULB5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDH7Q9ULB5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDH7Q9ULB5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDH7Q9ULB5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDH7Q9ULB5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDH7Q9ULB5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDH7Q9ULB5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDH7Q9ULB5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDH7Q9ULB5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDH7Q9ULB5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDH7Q9ULB5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDH7Q9ULB5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDH7Q9ULB5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDH7Q9ULB5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDH7Q9ULB5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CDH7Q9ULB5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDH7Q9ULB5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDH7Q9ULB5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDH7Q9ULB5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDH7Q9ULB5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDH7Q9ULB5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDH7Q9ULB5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDH7Q9ULB5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDH7Q9ULB5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDH7Q9ULB5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDH7Q9ULB5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDH7Q9ULB5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDH7Q9ULB5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDH7Q9ULB5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDH7Q9ULB5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDH7Q9ULB5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDH7Q9ULB5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDH7Q9ULB5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDH7Q9ULB5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDH7Q9ULB5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CDH7Q9ULB5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDH7Q9ULB5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDH7Q9ULB5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDH7Q9ULB5 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDH7Q9ULB5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDH7Q9ULB5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDH7Q9ULB5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDH7Q9ULB5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDH7Q9ULB5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDH7Q9ULB5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDH7Q9ULB5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDH7Q9ULB5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDH7Q9ULB5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDH7Q9ULB5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDH7Q9ULB5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDH7Q9ULB5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDH7Q9ULB5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDH7Q9ULB5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDH7Q9ULB5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms