Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG9

CROT, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROTQ9UKG9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CROTQ9UKG9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CROTQ9UKG9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CROTQ9UKG9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CROTQ9UKG9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CROTQ9UKG9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CROTQ9UKG9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CROTQ9UKG9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CROTQ9UKG9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CROTQ9UKG9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CROTQ9UKG9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CROTQ9UKG9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CROTQ9UKG9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CROTQ9UKG9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CROTQ9UKG9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CROTQ9UKG9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CROTQ9UKG9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CROTQ9UKG9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CROTQ9UKG9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CROTQ9UKG9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CROTQ9UKG9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CROTQ9UKG9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CROTQ9UKG9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CROTQ9UKG9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CROTQ9UKG9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CROTQ9UKG9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CROTQ9UKG9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CROTQ9UKG9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CROTQ9UKG9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CROTQ9UKG9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CROTQ9UKG9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CROTQ9UKG9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CROTQ9UKG9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CROTQ9UKG9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CROTQ9UKG9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CROTQ9UKG9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CROTQ9UKG9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CROTQ9UKG9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CROTQ9UKG9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CROTQ9UKG9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CROTQ9UKG9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CROTQ9UKG9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CROTQ9UKG9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CROTQ9UKG9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CROTQ9UKG9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CROTQ9UKG9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CROTQ9UKG9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CROTQ9UKG9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CROTQ9UKG9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CROTQ9UKG9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CROTQ9UKG9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CROTQ9UKG9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CROTQ9UKG9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CROTQ9UKG9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CROTQ9UKG9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CROTQ9UKG9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CROTQ9UKG9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CROTQ9UKG9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CROTQ9UKG9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CROTQ9UKG9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CROTQ9UKG9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CROTQ9UKG9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CROTQ9UKG9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CROTQ9UKG9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CROTQ9UKG9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CROTQ9UKG9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CROTQ9UKG9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CROTQ9UKG9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CROTQ9UKG9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CROTQ9UKG9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CROTQ9UKG9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CROTQ9UKG9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CROTQ9UKG9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CROTQ9UKG9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CROTQ9UKG9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CROTQ9UKG9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CROTQ9UKG9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CROTQ9UKG9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CROTQ9UKG9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CROTQ9UKG9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CROTQ9UKG9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CROTQ9UKG9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CROTQ9UKG9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CROTQ9UKG9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CROTQ9UKG9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CROTQ9UKG9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CROTQ9UKG9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CROTQ9UKG9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CROTQ9UKG9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CROTQ9UKG9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CROTQ9UKG9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CROTQ9UKG9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CROTQ9UKG9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CROTQ9UKG9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CROTQ9UKG9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CROTQ9UKG9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CROTQ9UKG9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CROTQ9UKG9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CROTQ9UKG9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CROTQ9UKG9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms