Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK00

C3orf18, Uncharacterized protein C3orf18, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf18Q9UK00 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
C3orf18Q9UK00 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
C3orf18Q9UK00 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
C3orf18Q9UK00 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
C3orf18Q9UK00 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
C3orf18Q9UK00 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
C3orf18Q9UK00 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
C3orf18Q9UK00 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
C3orf18Q9UK00 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
C3orf18Q9UK00 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
C3orf18Q9UK00 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
C3orf18Q9UK00 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
C3orf18Q9UK00 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
C3orf18Q9UK00 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
C3orf18Q9UK00 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
C3orf18Q9UK00 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
C3orf18Q9UK00 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C3orf18Q9UK00 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
C3orf18Q9UK00 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
C3orf18Q9UK00 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C3orf18Q9UK00 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C3orf18Q9UK00 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C3orf18Q9UK00 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C3orf18Q9UK00 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
C3orf18Q9UK00 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C3orf18Q9UK00 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C3orf18Q9UK00 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C3orf18Q9UK00 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C3orf18Q9UK00 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
C3orf18Q9UK00 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
C3orf18Q9UK00 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
C3orf18Q9UK00 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
C3orf18Q9UK00 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
C3orf18Q9UK00 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
C3orf18Q9UK00 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
C3orf18Q9UK00 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
C3orf18Q9UK00 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
C3orf18Q9UK00 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
C3orf18Q9UK00 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
C3orf18Q9UK00 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
C3orf18Q9UK00 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
C3orf18Q9UK00 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C3orf18Q9UK00 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
C3orf18Q9UK00 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C3orf18Q9UK00 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
C3orf18Q9UK00 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
C3orf18Q9UK00 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C3orf18Q9UK00 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
C3orf18Q9UK00 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C3orf18Q9UK00 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C3orf18Q9UK00 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C3orf18Q9UK00 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C3orf18Q9UK00 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
C3orf18Q9UK00 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C3orf18Q9UK00 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
C3orf18Q9UK00 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C3orf18Q9UK00 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C3orf18Q9UK00 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C3orf18Q9UK00 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C3orf18Q9UK00 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C3orf18Q9UK00 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C3orf18Q9UK00 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C3orf18Q9UK00 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C3orf18Q9UK00 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C3orf18Q9UK00 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C3orf18Q9UK00 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C3orf18Q9UK00 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
C3orf18Q9UK00 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C3orf18Q9UK00 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C3orf18Q9UK00 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C3orf18Q9UK00 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C3orf18Q9UK00 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C3orf18Q9UK00 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C3orf18Q9UK00 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C3orf18Q9UK00 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C3orf18Q9UK00 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C3orf18Q9UK00 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C3orf18Q9UK00 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C3orf18Q9UK00 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C3orf18Q9UK00 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C3orf18Q9UK00 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
C3orf18Q9UK00 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
C3orf18Q9UK00 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C3orf18Q9UK00 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C3orf18Q9UK00 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C3orf18Q9UK00 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C3orf18Q9UK00 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C3orf18Q9UK00 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C3orf18Q9UK00 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
C3orf18Q9UK00 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C3orf18Q9UK00 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C3orf18Q9UK00 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C3orf18Q9UK00 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C3orf18Q9UK00 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
C3orf18Q9UK00 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C3orf18Q9UK00 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C3orf18Q9UK00 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C3orf18Q9UK00 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C3orf18Q9UK00 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
C3orf18Q9UK00 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms