Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJA2

CRLS1, Cardiolipin synthase (CMP-forming), humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRLS1Q9UJA2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CRLS1Q9UJA2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CRLS1Q9UJA2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CRLS1Q9UJA2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CRLS1Q9UJA2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CRLS1Q9UJA2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CRLS1Q9UJA2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CRLS1Q9UJA2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CRLS1Q9UJA2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CRLS1Q9UJA2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CRLS1Q9UJA2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CRLS1Q9UJA2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CRLS1Q9UJA2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CRLS1Q9UJA2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CRLS1Q9UJA2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CRLS1Q9UJA2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CRLS1Q9UJA2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CRLS1Q9UJA2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CRLS1Q9UJA2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CRLS1Q9UJA2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CRLS1Q9UJA2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CRLS1Q9UJA2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CRLS1Q9UJA2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CRLS1Q9UJA2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CRLS1Q9UJA2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CRLS1Q9UJA2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CRLS1Q9UJA2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CRLS1Q9UJA2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CRLS1Q9UJA2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CRLS1Q9UJA2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CRLS1Q9UJA2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CRLS1Q9UJA2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CRLS1Q9UJA2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CRLS1Q9UJA2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CRLS1Q9UJA2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CRLS1Q9UJA2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CRLS1Q9UJA2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CRLS1Q9UJA2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CRLS1Q9UJA2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CRLS1Q9UJA2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CRLS1Q9UJA2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CRLS1Q9UJA2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CRLS1Q9UJA2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CRLS1Q9UJA2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CRLS1Q9UJA2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CRLS1Q9UJA2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CRLS1Q9UJA2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CRLS1Q9UJA2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CRLS1Q9UJA2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CRLS1Q9UJA2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CRLS1Q9UJA2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CRLS1Q9UJA2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CRLS1Q9UJA2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CRLS1Q9UJA2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CRLS1Q9UJA2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CRLS1Q9UJA2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CRLS1Q9UJA2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CRLS1Q9UJA2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CRLS1Q9UJA2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CRLS1Q9UJA2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CRLS1Q9UJA2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CRLS1Q9UJA2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CRLS1Q9UJA2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CRLS1Q9UJA2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CRLS1Q9UJA2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CRLS1Q9UJA2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CRLS1Q9UJA2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CRLS1Q9UJA2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CRLS1Q9UJA2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CRLS1Q9UJA2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CRLS1Q9UJA2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CRLS1Q9UJA2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CRLS1Q9UJA2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CRLS1Q9UJA2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CRLS1Q9UJA2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CRLS1Q9UJA2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CRLS1Q9UJA2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CRLS1Q9UJA2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CRLS1Q9UJA2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CRLS1Q9UJA2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CRLS1Q9UJA2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CRLS1Q9UJA2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CRLS1Q9UJA2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CRLS1Q9UJA2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CRLS1Q9UJA2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CRLS1Q9UJA2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CRLS1Q9UJA2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CRLS1Q9UJA2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CRLS1Q9UJA2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CRLS1Q9UJA2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
CRLS1Q9UJA2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CRLS1Q9UJA2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CRLS1Q9UJA2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CRLS1Q9UJA2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CRLS1Q9UJA2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CRLS1Q9UJA2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CRLS1Q9UJA2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CRLS1Q9UJA2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CRLS1Q9UJA2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CRLS1Q9UJA2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms