Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
CTNNA3Q9UI47 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
CTNNA3Q9UI47 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
CTNNA3Q9UI47 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
CTNNA3Q9UI47 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
CTNNA3Q9UI47 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
CTNNA3Q9UI47 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
CTNNA3Q9UI47 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
CTNNA3Q9UI47 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
CTNNA3Q9UI47 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
CTNNA3Q9UI47 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
CTNNA3Q9UI47 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
CTNNA3Q9UI47 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
CTNNA3Q9UI47 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
CTNNA3Q9UI47 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
CTNNA3Q9UI47 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
CTNNA3Q9UI47 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
CTNNA3Q9UI47 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
CTNNA3Q9UI47 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CTNNA3Q9UI47 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
CTNNA3Q9UI47 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CTNNA3Q9UI47 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CTNNA3Q9UI47 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC31.78■■■□□ 2.68
CTNNA3Q9UI47 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
CTNNA3Q9UI47 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
CTNNA3Q9UI47 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
CTNNA3Q9UI47 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.67
CTNNA3Q9UI47 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
CTNNA3Q9UI47 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
CTNNA3Q9UI47 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
CTNNA3Q9UI47 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CTNNA3Q9UI47 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
CTNNA3Q9UI47 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CTNNA3Q9UI47 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CTNNA3Q9UI47 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
CTNNA3Q9UI47 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
CTNNA3Q9UI47 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CTNNA3Q9UI47 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC31.7■■■□□ 2.67
CTNNA3Q9UI47 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
CTNNA3Q9UI47 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
CTNNA3Q9UI47 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
CTNNA3Q9UI47 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CTNNA3Q9UI47 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CTNNA3Q9UI47 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CTNNA3Q9UI47 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
CTNNA3Q9UI47 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CTNNA3Q9UI47 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CTNNA3Q9UI47 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CTNNA3Q9UI47 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CTNNA3Q9UI47 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
CTNNA3Q9UI47 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CTNNA3Q9UI47 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CTNNA3Q9UI47 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CTNNA3Q9UI47 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CTNNA3Q9UI47 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CTNNA3Q9UI47 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
CTNNA3Q9UI47 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
CTNNA3Q9UI47 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
CTNNA3Q9UI47 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CTNNA3Q9UI47 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CTNNA3Q9UI47 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CTNNA3Q9UI47 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CTNNA3Q9UI47 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CTNNA3Q9UI47 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CTNNA3Q9UI47 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CTNNA3Q9UI47 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CTNNA3Q9UI47 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CTNNA3Q9UI47 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CTNNA3Q9UI47 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
CTNNA3Q9UI47 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CTNNA3Q9UI47 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CTNNA3Q9UI47 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
CTNNA3Q9UI47 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
CTNNA3Q9UI47 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
CTNNA3Q9UI47 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
CTNNA3Q9UI47 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CTNNA3Q9UI47 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CTNNA3Q9UI47 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CTNNA3Q9UI47 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CTNNA3Q9UI47 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
CTNNA3Q9UI47 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CTNNA3Q9UI47 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CTNNA3Q9UI47 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CTNNA3Q9UI47 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CTNNA3Q9UI47 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
CTNNA3Q9UI47 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CTNNA3Q9UI47 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CTNNA3Q9UI47 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CTNNA3Q9UI47 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CTNNA3Q9UI47 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CTNNA3Q9UI47 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
CTNNA3Q9UI47 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CTNNA3Q9UI47 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CTNNA3Q9UI47 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CTNNA3Q9UI47 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CTNNA3Q9UI47 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
CTNNA3Q9UI47 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CTNNA3Q9UI47 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CTNNA3Q9UI47 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CTNNA3Q9UI47 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms