Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CNTNAP2Q9UHC6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CNTNAP2Q9UHC6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CNTNAP2Q9UHC6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CNTNAP2Q9UHC6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CNTNAP2Q9UHC6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CNTNAP2Q9UHC6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CNTNAP2Q9UHC6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CNTNAP2Q9UHC6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CNTNAP2Q9UHC6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CNTNAP2Q9UHC6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CNTNAP2Q9UHC6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CNTNAP2Q9UHC6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CNTNAP2Q9UHC6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CNTNAP2Q9UHC6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CNTNAP2Q9UHC6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CNTNAP2Q9UHC6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CNTNAP2Q9UHC6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CNTNAP2Q9UHC6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CNTNAP2Q9UHC6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CNTNAP2Q9UHC6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CNTNAP2Q9UHC6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CNTNAP2Q9UHC6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CNTNAP2Q9UHC6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
CNTNAP2Q9UHC6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CNTNAP2Q9UHC6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CNTNAP2Q9UHC6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CNTNAP2Q9UHC6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CNTNAP2Q9UHC6 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CNTNAP2Q9UHC6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CNTNAP2Q9UHC6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CNTNAP2Q9UHC6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CNTNAP2Q9UHC6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CNTNAP2Q9UHC6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CNTNAP2Q9UHC6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CNTNAP2Q9UHC6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CNTNAP2Q9UHC6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CNTNAP2Q9UHC6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CNTNAP2Q9UHC6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CNTNAP2Q9UHC6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CNTNAP2Q9UHC6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CNTNAP2Q9UHC6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CNTNAP2Q9UHC6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CNTNAP2Q9UHC6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CNTNAP2Q9UHC6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CNTNAP2Q9UHC6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CNTNAP2Q9UHC6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CNTNAP2Q9UHC6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CNTNAP2Q9UHC6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CNTNAP2Q9UHC6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CNTNAP2Q9UHC6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CNTNAP2Q9UHC6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CNTNAP2Q9UHC6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CNTNAP2Q9UHC6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CNTNAP2Q9UHC6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CNTNAP2Q9UHC6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CNTNAP2Q9UHC6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CNTNAP2Q9UHC6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CNTNAP2Q9UHC6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.25
CNTNAP2Q9UHC6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
CNTNAP2Q9UHC6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.25
CNTNAP2Q9UHC6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CNTNAP2Q9UHC6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CNTNAP2Q9UHC6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CNTNAP2Q9UHC6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CNTNAP2Q9UHC6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CNTNAP2Q9UHC6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CNTNAP2Q9UHC6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CNTNAP2Q9UHC6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CNTNAP2Q9UHC6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CNTNAP2Q9UHC6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CNTNAP2Q9UHC6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CNTNAP2Q9UHC6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CNTNAP2Q9UHC6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CNTNAP2Q9UHC6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CNTNAP2Q9UHC6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CNTNAP2Q9UHC6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CNTNAP2Q9UHC6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CNTNAP2Q9UHC6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CNTNAP2Q9UHC6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CNTNAP2Q9UHC6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CNTNAP2Q9UHC6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CNTNAP2Q9UHC6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CNTNAP2Q9UHC6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CNTNAP2Q9UHC6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CNTNAP2Q9UHC6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CNTNAP2Q9UHC6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CNTNAP2Q9UHC6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CNTNAP2Q9UHC6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CNTNAP2Q9UHC6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CNTNAP2Q9UHC6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CNTNAP2Q9UHC6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CNTNAP2Q9UHC6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CNTNAP2Q9UHC6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CNTNAP2Q9UHC6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CNTNAP2Q9UHC6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CNTNAP2Q9UHC6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CNTNAP2Q9UHC6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms