Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH73

EBF1, Transcription factor COE1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF1Q9UH73 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EBF1Q9UH73 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EBF1Q9UH73 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EBF1Q9UH73 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
EBF1Q9UH73 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
EBF1Q9UH73 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
EBF1Q9UH73 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
EBF1Q9UH73 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
EBF1Q9UH73 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
EBF1Q9UH73 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
EBF1Q9UH73 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
EBF1Q9UH73 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
EBF1Q9UH73 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
EBF1Q9UH73 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
EBF1Q9UH73 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
EBF1Q9UH73 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
EBF1Q9UH73 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
EBF1Q9UH73 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
EBF1Q9UH73 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
EBF1Q9UH73 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
EBF1Q9UH73 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
EBF1Q9UH73 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
EBF1Q9UH73 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EBF1Q9UH73 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
EBF1Q9UH73 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
EBF1Q9UH73 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
EBF1Q9UH73 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
EBF1Q9UH73 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
EBF1Q9UH73 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EBF1Q9UH73 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EBF1Q9UH73 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
EBF1Q9UH73 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
EBF1Q9UH73 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
EBF1Q9UH73 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
EBF1Q9UH73 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
EBF1Q9UH73 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
EBF1Q9UH73 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
EBF1Q9UH73 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
EBF1Q9UH73 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EBF1Q9UH73 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EBF1Q9UH73 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
EBF1Q9UH73 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EBF1Q9UH73 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EBF1Q9UH73 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
EBF1Q9UH73 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EBF1Q9UH73 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EBF1Q9UH73 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EBF1Q9UH73 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EBF1Q9UH73 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EBF1Q9UH73 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EBF1Q9UH73 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EBF1Q9UH73 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
EBF1Q9UH73 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
EBF1Q9UH73 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
EBF1Q9UH73 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EBF1Q9UH73 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
EBF1Q9UH73 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
EBF1Q9UH73 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
EBF1Q9UH73 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EBF1Q9UH73 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
EBF1Q9UH73 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
EBF1Q9UH73 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
EBF1Q9UH73 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
EBF1Q9UH73 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
EBF1Q9UH73 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
EBF1Q9UH73 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EBF1Q9UH73 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EBF1Q9UH73 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
EBF1Q9UH73 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.92
EBF1Q9UH73 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
EBF1Q9UH73 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
EBF1Q9UH73 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
EBF1Q9UH73 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
EBF1Q9UH73 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
EBF1Q9UH73 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27■■□□□ 1.91
EBF1Q9UH73 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27■■□□□ 1.91
EBF1Q9UH73 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27■■□□□ 1.91
EBF1Q9UH73 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EBF1Q9UH73 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EBF1Q9UH73 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EBF1Q9UH73 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
EBF1Q9UH73 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
EBF1Q9UH73 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EBF1Q9UH73 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
EBF1Q9UH73 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
EBF1Q9UH73 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EBF1Q9UH73 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
EBF1Q9UH73 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
EBF1Q9UH73 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
EBF1Q9UH73 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EBF1Q9UH73 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EBF1Q9UH73 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EBF1Q9UH73 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EBF1Q9UH73 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
EBF1Q9UH73 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
EBF1Q9UH73 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EBF1Q9UH73 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EBF1Q9UH73 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EBF1Q9UH73 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EBF1Q9UH73 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms