Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGY1

NOL12, Nucleolar protein 12, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOL12Q9UGY1 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.721e-9■■■■□ 22.9
NOL12Q9UGY1 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.493e-6■■■■□ 22.9
NOL12Q9UGY1 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.41e-9■■■■□ 22.9
NOL12Q9UGY1 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.133e-6■■■■□ 22.9
NOL12Q9UGY1 PTK7-217ENST00000490710 582 ntTSL 215.16■□□□□ 0.021e-9■■■■□ 22.9
NOL12Q9UGY1 PTK7-214ENST00000481946 807 ntTSL 313.27□□□□□ -0.291e-9■■■■□ 22.9
NOL12Q9UGY1 COL2A1-208ENST00000493991 3756 ntTSL 212.91□□□□□ -0.343e-6■■■■□ 22.9
NOL12Q9UGY1 UBR4-212ENST00000475973 600 ntTSL 37.77□□□□□ -1.176e-7■■■■□ 22.8
NOL12Q9UGY1 HSPA9-207ENST00000507097 1796 ntTSL 215.66■□□□□ 0.11e-323■■■■□ 22.8
NOL12Q9UGY1 HSPA9-212ENST00000523929 780 ntTSL 413.85□□□□□ -0.191e-323■■■■□ 22.8
NOL12Q9UGY1 HSPA9-201ENST00000297185 3321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.561e-323■■■■□ 22.8
NOL12Q9UGY1 HSPA9-210ENST00000508003 582 ntTSL 210.38□□□□□ -0.751e-323■■■■□ 22.8
NOL12Q9UGY1 HSPA9-202ENST00000501917 275 ntTSL 33.39□□□□□ -1.871e-323■■■■□ 22.8
NOL12Q9UGY1 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC1.79□□□□□ -2.121e-323■■■■□ 22.8
NOL12Q9UGY1 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.08■□□□□ 0.325e-39■■■■□ 22.8
NOL12Q9UGY1 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC14.51□□□□□ -0.095e-39■■■■□ 22.8
NOL12Q9UGY1 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.295e-39■■■■□ 22.8
NOL12Q9UGY1 VWCE-204ENST00000535599 883 ntTSL 215.68■□□□□ 0.13e-6■■■■□ 22.5
NOL12Q9UGY1 PLEC-210ENST00000527096 13713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.262e-6■■■■□ 22.5
NOL12Q9UGY1 LRP1-211ENST00000556356 5114 ntTSL 216.59■□□□□ 0.253e-8■■■■□ 22.5
NOL12Q9UGY1 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.512e-6■■■■□ 22.4
NOL12Q9UGY1 A1BG-203ENST00000596924 2134 ntTSL 1 (best)20.23■□□□□ 0.832e-19■■■■□ 22.3
NOL12Q9UGY1 A1BG-204ENST00000598345 475 ntTSL 1 (best)19.7■□□□□ 0.742e-19■■■■□ 22.3
NOL12Q9UGY1 RTEL1-202ENST00000356810 1339 ntTSL 1 (best)13.98□□□□□ -0.171e-7■■■■□ 22.2
NOL12Q9UGY1 RTEL1-207ENST00000463361 575 ntTSL 413.41□□□□□ -0.261e-7■■■■□ 22.2
NOL12Q9UGY1 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.29■■□□□ 16e-7■■■■□ 22.1
NOL12Q9UGY1 NSMF-207ENST00000371482 2888 ntTSL 1 (best)18.9■□□□□ 0.624e-8■■■■□ 22
NOL12Q9UGY1 NR1H4-202ENST00000321046 1779 ntTSL 1 (best)13.15□□□□□ -0.312e-8■■■■□ 21.8
NOL12Q9UGY1 NR1H4-203ENST00000392986 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.312e-8■■■■□ 21.8
NOL12Q9UGY1 NR1H4-201ENST00000188403 1630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.562e-8■■■■□ 21.8
NOL12Q9UGY1 NR1H4-207ENST00000549996 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.722e-8■■■■□ 21.8
NOL12Q9UGY1 NR1H4-209ENST00000551379 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.862e-8■■■■□ 21.8
NOL12Q9UGY1 NR1H4-206ENST00000548884 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.12e-8■■■■□ 21.8
NOL12Q9UGY1 PUM1-202ENST00000373741 4242 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.261e-31■■■■□ 21.7
NOL12Q9UGY1 PUM1-201ENST00000257075 5360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.571e-31■■■■□ 21.7
NOL12Q9UGY1 PUM1-208ENST00000471894 812 ntTSL 310.76□□□□□ -0.691e-31■■■■□ 21.7
NOL12Q9UGY1 PUM1-210ENST00000490546 707 ntTSL 410.47□□□□□ -0.731e-31■■■■□ 21.7
NOL12Q9UGY1 PUM1-203ENST00000373742 3515 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.811e-31■■■■□ 21.7
NOL12Q9UGY1 PUM1-204ENST00000373747 5375 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.861e-31■■■■□ 21.7
NOL12Q9UGY1 PUM1-205ENST00000424085 4631 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.011e-31■■■■□ 21.7
NOL12Q9UGY1 PUM1-214ENST00000525843 4528 ntTSL 58.31□□□□□ -1.081e-31■■■■□ 21.7
NOL12Q9UGY1 PUM1-223ENST00000532678 793 ntTSL 47.8□□□□□ -1.161e-31■■■■□ 21.7
NOL12Q9UGY1 PUM1-211ENST00000498419 3068 ntTSL 57.67□□□□□ -1.181e-31■■■■□ 21.7
NOL12Q9UGY1 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.251e-31■■■■□ 21.7
NOL12Q9UGY1 PUM1-206ENST00000426105 4043 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.31e-31■■■■□ 21.7
NOL12Q9UGY1 CPSF1-205ENST00000531042 580 ntTSL 513.99□□□□□ -0.173e-6■■■■□ 21.7
NOL12Q9UGY1 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.212e-12■■■■□ 21.6
NOL12Q9UGY1 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.852e-12■■■■□ 21.6
NOL12Q9UGY1 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.772e-12■■■■□ 21.6
NOL12Q9UGY1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.173e-6■■■■□ 21.5
NOL12Q9UGY1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.013e-6■■■■□ 21.5
NOL12Q9UGY1 MFSD12-208ENST00000588918 2040 ntTSL 527.59■■■□□ 2.013e-6■■■■□ 21.5
NOL12Q9UGY1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.23e-6■■■■□ 21.5
NOL12Q9UGY1 SSUH2-205ENST00000420394 1634 ntTSL 1 (best)22.23■■□□□ 1.153e-6■■■■□ 21.5
NOL12Q9UGY1 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.133e-6■■■■□ 21.5
NOL12Q9UGY1 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.123e-6■■■■□ 21.5
NOL12Q9UGY1 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.033e-6■■■■□ 21.5
NOL12Q9UGY1 MCM7-209ENST00000485286 2900 ntTSL 221.32■■□□□ 13e-6■■■■□ 21.5
NOL12Q9UGY1 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.843e-6■■■■□ 21.5
NOL12Q9UGY1 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.843e-6■■■■□ 21.5
NOL12Q9UGY1 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.826e-9■■■■□ 21.5
NOL12Q9UGY1 ACAP3-212ENST00000492936 5319 ntTSL 1 (best)20.03■□□□□ 0.83e-6■■■■□ 21.5
NOL12Q9UGY1 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.773e-6■■■■□ 21.5
NOL12Q9UGY1 SSUH2-216ENST00000495366 2386 ntTSL 219.78■□□□□ 0.763e-6■■■■□ 21.5
NOL12Q9UGY1 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.746e-9■■■■□ 21.5
NOL12Q9UGY1 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.73e-6■■■■□ 21.5
NOL12Q9UGY1 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.696e-9■■■■□ 21.5
NOL12Q9UGY1 SSUH2-204ENST00000415132 1645 ntTSL 519.34■□□□□ 0.693e-6■■■■□ 21.5
NOL12Q9UGY1 TPR-205ENST00000474852 2757 ntTSL 1 (best)19.25■□□□□ 0.673e-6■■■■□ 21.5
NOL12Q9UGY1 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.628e-8■■■■□ 21.5
NOL12Q9UGY1 MFSD12-211ENST00000589995 777 ntTSL 318.22■□□□□ 0.513e-6■■■■□ 21.5
NOL12Q9UGY1 NINL-206ENST00000489780 630 ntTSL 317.4■□□□□ 0.386e-9■■■■□ 21.5
NOL12Q9UGY1 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.33e-6■■■■□ 21.5
NOL12Q9UGY1 ATP13A1-213ENST00000497156 715 ntTSL 216.67■□□□□ 0.263e-6■■■■□ 21.5
NOL12Q9UGY1 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.213e-6■■■■□ 21.5
NOL12Q9UGY1 RECQL5-205ENST00000443199 3089 ntTSL 1 (best)16.32■□□□□ 0.23e-6■■■■□ 21.5
NOL12Q9UGY1 SSUH2-203ENST00000413305 1874 ntTSL 1 (best)15.83■□□□□ 0.123e-6■■■■□ 21.5
NOL12Q9UGY1 ZC3H18-212ENST00000569435 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 515.7■□□□□ 0.13e-6■■■■□ 21.5
NOL12Q9UGY1 RECQL5-216ENST00000582548 709 ntTSL 515.68■□□□□ 0.13e-6■■■■□ 21.5
NOL12Q9UGY1 RC3H2-205ENST00000423239 3623 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.081e-25■■■■□ 21.5
NOL12Q9UGY1 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.073e-6■■■■□ 21.5
NOL12Q9UGY1 SSUH2-207ENST00000435138 2632 ntTSL 215.43■□□□□ 0.063e-6■■■■□ 21.5
NOL12Q9UGY1 VEGFA-215ENST00000497139 2746 ntTSL 1 (best)15.31■□□□□ 0.043e-6■■■■□ 21.5
NOL12Q9UGY1 NLGN2-202ENST00000570940 581 ntTSL 315.19■□□□□ 0.023e-6■■■■□ 21.5
NOL12Q9UGY1 ZC3H18-202ENST00000452588 3211 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.023e-6■■■■□ 21.5
NOL12Q9UGY1 RC3H2-201ENST00000335387 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.021e-25■■■■□ 21.5
NOL12Q9UGY1 MCM7-213ENST00000621318 3084 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.023e-6■■■■□ 21.5
NOL12Q9UGY1 MFSD12-212ENST00000591878 557 ntTSL 515□□□□□ -0.013e-6■■■■□ 21.5
NOL12Q9UGY1 MFSD12-205ENST00000585814 1002 ntTSL 314.93□□□□□ -0.023e-6■■■■□ 21.5
NOL12Q9UGY1 RECQL5-204ENST00000423245 3576 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.033e-6■■■■□ 21.5
NOL12Q9UGY1 TPR-201ENST00000367478 9708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.083e-6■■■■□ 21.5
NOL12Q9UGY1 NINL-204ENST00000461642 594 ntTSL 314.23□□□□□ -0.136e-9■■■■□ 21.5
NOL12Q9UGY1 ENC1-206ENST00000537006 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.146e-9■■■■□ 21.5
NOL12Q9UGY1 MCM7-201ENST00000303887 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.143e-6■■■■□ 21.5
NOL12Q9UGY1 RECQL5-201ENST00000317905 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.143e-6■■■■□ 21.5
NOL12Q9UGY1 RC3H2-210ENST00000498479 5746 ntTSL 213.8□□□□□ -0.21e-25■■■■□ 21.5
NOL12Q9UGY1 SSUH2-201ENST00000317371 2561 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.213e-6■■■■□ 21.5
NOL12Q9UGY1 SSUH2-208ENST00000455157 3219 ntTSL 213.34□□□□□ -0.273e-6■■■■□ 21.5
NOL12Q9UGY1 MFSD12-213ENST00000592652 486 ntTSL 513.15□□□□□ -0.33e-6■■■■□ 21.5
NOL12Q9UGY1 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.323e-6■■■■□ 21.5
Retrieved 100 of 4,605 protein–RNA pairs in 245.2 ms