Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGI6

KCNN3, Small conductance calcium-activated potassium channel protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNN3Q9UGI6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNN3Q9UGI6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNN3Q9UGI6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCNN3Q9UGI6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCNN3Q9UGI6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
KCNN3Q9UGI6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KCNN3Q9UGI6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KCNN3Q9UGI6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNN3Q9UGI6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNN3Q9UGI6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNN3Q9UGI6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNN3Q9UGI6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNN3Q9UGI6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNN3Q9UGI6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNN3Q9UGI6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNN3Q9UGI6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNN3Q9UGI6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNN3Q9UGI6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNN3Q9UGI6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNN3Q9UGI6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNN3Q9UGI6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNN3Q9UGI6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNN3Q9UGI6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNN3Q9UGI6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNN3Q9UGI6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNN3Q9UGI6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNN3Q9UGI6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNN3Q9UGI6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNN3Q9UGI6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNN3Q9UGI6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNN3Q9UGI6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNN3Q9UGI6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNN3Q9UGI6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNN3Q9UGI6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KCNN3Q9UGI6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KCNN3Q9UGI6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNN3Q9UGI6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNN3Q9UGI6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNN3Q9UGI6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNN3Q9UGI6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNN3Q9UGI6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNN3Q9UGI6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNN3Q9UGI6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNN3Q9UGI6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCNN3Q9UGI6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KCNN3Q9UGI6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KCNN3Q9UGI6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCNN3Q9UGI6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCNN3Q9UGI6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
KCNN3Q9UGI6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCNN3Q9UGI6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCNN3Q9UGI6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCNN3Q9UGI6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCNN3Q9UGI6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCNN3Q9UGI6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCNN3Q9UGI6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCNN3Q9UGI6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCNN3Q9UGI6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
KCNN3Q9UGI6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCNN3Q9UGI6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCNN3Q9UGI6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCNN3Q9UGI6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCNN3Q9UGI6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCNN3Q9UGI6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCNN3Q9UGI6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCNN3Q9UGI6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCNN3Q9UGI6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNN3Q9UGI6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNN3Q9UGI6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNN3Q9UGI6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNN3Q9UGI6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNN3Q9UGI6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNN3Q9UGI6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNN3Q9UGI6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNN3Q9UGI6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNN3Q9UGI6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNN3Q9UGI6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNN3Q9UGI6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNN3Q9UGI6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNN3Q9UGI6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNN3Q9UGI6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNN3Q9UGI6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNN3Q9UGI6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNN3Q9UGI6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
KCNN3Q9UGI6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNN3Q9UGI6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNN3Q9UGI6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNN3Q9UGI6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNN3Q9UGI6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNN3Q9UGI6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNN3Q9UGI6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNN3Q9UGI6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNN3Q9UGI6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNN3Q9UGI6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNN3Q9UGI6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNN3Q9UGI6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNN3Q9UGI6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNN3Q9UGI6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNN3Q9UGI6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNN3Q9UGI6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms