Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ6

EXTL2, Exostosin-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL2Q9UBQ6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EXTL2Q9UBQ6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EXTL2Q9UBQ6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EXTL2Q9UBQ6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EXTL2Q9UBQ6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EXTL2Q9UBQ6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EXTL2Q9UBQ6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXTL2Q9UBQ6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXTL2Q9UBQ6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXTL2Q9UBQ6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXTL2Q9UBQ6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXTL2Q9UBQ6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EXTL2Q9UBQ6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EXTL2Q9UBQ6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EXTL2Q9UBQ6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EXTL2Q9UBQ6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EXTL2Q9UBQ6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EXTL2Q9UBQ6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EXTL2Q9UBQ6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EXTL2Q9UBQ6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EXTL2Q9UBQ6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXTL2Q9UBQ6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXTL2Q9UBQ6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EXTL2Q9UBQ6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EXTL2Q9UBQ6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EXTL2Q9UBQ6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EXTL2Q9UBQ6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EXTL2Q9UBQ6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
EXTL2Q9UBQ6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXTL2Q9UBQ6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXTL2Q9UBQ6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXTL2Q9UBQ6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXTL2Q9UBQ6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXTL2Q9UBQ6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EXTL2Q9UBQ6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EXTL2Q9UBQ6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EXTL2Q9UBQ6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EXTL2Q9UBQ6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXTL2Q9UBQ6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXTL2Q9UBQ6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EXTL2Q9UBQ6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EXTL2Q9UBQ6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EXTL2Q9UBQ6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EXTL2Q9UBQ6 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EXTL2Q9UBQ6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EXTL2Q9UBQ6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EXTL2Q9UBQ6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EXTL2Q9UBQ6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EXTL2Q9UBQ6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EXTL2Q9UBQ6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EXTL2Q9UBQ6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
EXTL2Q9UBQ6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EXTL2Q9UBQ6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EXTL2Q9UBQ6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXTL2Q9UBQ6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXTL2Q9UBQ6 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXTL2Q9UBQ6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXTL2Q9UBQ6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXTL2Q9UBQ6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXTL2Q9UBQ6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXTL2Q9UBQ6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXTL2Q9UBQ6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXTL2Q9UBQ6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXTL2Q9UBQ6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXTL2Q9UBQ6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
EXTL2Q9UBQ6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXTL2Q9UBQ6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXTL2Q9UBQ6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXTL2Q9UBQ6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXTL2Q9UBQ6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
EXTL2Q9UBQ6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXTL2Q9UBQ6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXTL2Q9UBQ6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EXTL2Q9UBQ6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EXTL2Q9UBQ6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EXTL2Q9UBQ6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EXTL2Q9UBQ6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EXTL2Q9UBQ6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
EXTL2Q9UBQ6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXTL2Q9UBQ6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXTL2Q9UBQ6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXTL2Q9UBQ6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXTL2Q9UBQ6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXTL2Q9UBQ6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EXTL2Q9UBQ6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EXTL2Q9UBQ6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EXTL2Q9UBQ6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EXTL2Q9UBQ6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EXTL2Q9UBQ6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
EXTL2Q9UBQ6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EXTL2Q9UBQ6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXTL2Q9UBQ6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXTL2Q9UBQ6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXTL2Q9UBQ6 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EXTL2Q9UBQ6 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EXTL2Q9UBQ6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EXTL2Q9UBQ6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EXTL2Q9UBQ6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EXTL2Q9UBQ6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EXTL2Q9UBQ6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.1 ms