Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SPASTQ9UBP0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPASTQ9UBP0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SPASTQ9UBP0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SPASTQ9UBP0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SPASTQ9UBP0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SPASTQ9UBP0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SPASTQ9UBP0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SPASTQ9UBP0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SPASTQ9UBP0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SPASTQ9UBP0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SPASTQ9UBP0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SPASTQ9UBP0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SPASTQ9UBP0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SPASTQ9UBP0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SPASTQ9UBP0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SPASTQ9UBP0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SPASTQ9UBP0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SPASTQ9UBP0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SPASTQ9UBP0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SPASTQ9UBP0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SPASTQ9UBP0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SPASTQ9UBP0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SPASTQ9UBP0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SPASTQ9UBP0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SPASTQ9UBP0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SPASTQ9UBP0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SPASTQ9UBP0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SPASTQ9UBP0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SPASTQ9UBP0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SPASTQ9UBP0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SPASTQ9UBP0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SPASTQ9UBP0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SPASTQ9UBP0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SPASTQ9UBP0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SPASTQ9UBP0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SPASTQ9UBP0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SPASTQ9UBP0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SPASTQ9UBP0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SPASTQ9UBP0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SPASTQ9UBP0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPASTQ9UBP0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPASTQ9UBP0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPASTQ9UBP0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPASTQ9UBP0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPASTQ9UBP0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPASTQ9UBP0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SPASTQ9UBP0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SPASTQ9UBP0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPASTQ9UBP0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPASTQ9UBP0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPASTQ9UBP0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPASTQ9UBP0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPASTQ9UBP0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPASTQ9UBP0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SPASTQ9UBP0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPASTQ9UBP0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SPASTQ9UBP0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SPASTQ9UBP0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SPASTQ9UBP0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SPASTQ9UBP0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPASTQ9UBP0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPASTQ9UBP0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SPASTQ9UBP0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SPASTQ9UBP0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SPASTQ9UBP0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPASTQ9UBP0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPASTQ9UBP0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SPASTQ9UBP0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPASTQ9UBP0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPASTQ9UBP0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SPASTQ9UBP0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SPASTQ9UBP0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SPASTQ9UBP0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SPASTQ9UBP0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SPASTQ9UBP0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SPASTQ9UBP0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPASTQ9UBP0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPASTQ9UBP0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPASTQ9UBP0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPASTQ9UBP0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SPASTQ9UBP0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPASTQ9UBP0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPASTQ9UBP0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPASTQ9UBP0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPASTQ9UBP0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPASTQ9UBP0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPASTQ9UBP0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPASTQ9UBP0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPASTQ9UBP0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPASTQ9UBP0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPASTQ9UBP0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPASTQ9UBP0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPASTQ9UBP0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPASTQ9UBP0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SPASTQ9UBP0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SPASTQ9UBP0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPASTQ9UBP0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPASTQ9UBP0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPASTQ9UBP0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.2 ms