Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB4

ATXN10, Ataxin-10, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN10Q9UBB4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATXN10Q9UBB4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATXN10Q9UBB4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATXN10Q9UBB4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATXN10Q9UBB4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATXN10Q9UBB4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATXN10Q9UBB4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ATXN10Q9UBB4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATXN10Q9UBB4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATXN10Q9UBB4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATXN10Q9UBB4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ATXN10Q9UBB4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATXN10Q9UBB4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATXN10Q9UBB4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATXN10Q9UBB4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATXN10Q9UBB4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATXN10Q9UBB4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ATXN10Q9UBB4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ATXN10Q9UBB4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATXN10Q9UBB4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATXN10Q9UBB4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATXN10Q9UBB4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATXN10Q9UBB4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATXN10Q9UBB4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATXN10Q9UBB4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATXN10Q9UBB4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATXN10Q9UBB4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATXN10Q9UBB4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATXN10Q9UBB4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATXN10Q9UBB4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATXN10Q9UBB4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATXN10Q9UBB4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATXN10Q9UBB4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATXN10Q9UBB4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATXN10Q9UBB4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATXN10Q9UBB4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATXN10Q9UBB4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATXN10Q9UBB4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATXN10Q9UBB4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATXN10Q9UBB4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATXN10Q9UBB4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATXN10Q9UBB4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATXN10Q9UBB4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATXN10Q9UBB4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATXN10Q9UBB4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATXN10Q9UBB4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATXN10Q9UBB4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATXN10Q9UBB4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATXN10Q9UBB4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATXN10Q9UBB4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATXN10Q9UBB4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATXN10Q9UBB4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATXN10Q9UBB4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ATXN10Q9UBB4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATXN10Q9UBB4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATXN10Q9UBB4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATXN10Q9UBB4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATXN10Q9UBB4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATXN10Q9UBB4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATXN10Q9UBB4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATXN10Q9UBB4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATXN10Q9UBB4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATXN10Q9UBB4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATXN10Q9UBB4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATXN10Q9UBB4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATXN10Q9UBB4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATXN10Q9UBB4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATXN10Q9UBB4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATXN10Q9UBB4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATXN10Q9UBB4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATXN10Q9UBB4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATXN10Q9UBB4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATXN10Q9UBB4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATXN10Q9UBB4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATXN10Q9UBB4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATXN10Q9UBB4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATXN10Q9UBB4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATXN10Q9UBB4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATXN10Q9UBB4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATXN10Q9UBB4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATXN10Q9UBB4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATXN10Q9UBB4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATXN10Q9UBB4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATXN10Q9UBB4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATXN10Q9UBB4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATXN10Q9UBB4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATXN10Q9UBB4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATXN10Q9UBB4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATXN10Q9UBB4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATXN10Q9UBB4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATXN10Q9UBB4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATXN10Q9UBB4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATXN10Q9UBB4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATXN10Q9UBB4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATXN10Q9UBB4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATXN10Q9UBB4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ATXN10Q9UBB4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATXN10Q9UBB4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATXN10Q9UBB4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATXN10Q9UBB4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms