Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Psmb3Q9R1P1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Psmb3Q9R1P1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Psmb3Q9R1P1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Psmb3Q9R1P1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Psmb3Q9R1P1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Psmb3Q9R1P1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Psmb3Q9R1P1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Psmb3Q9R1P1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Psmb3Q9R1P1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Psmb3Q9R1P1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Psmb3Q9R1P1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Psmb3Q9R1P1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Psmb3Q9R1P1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Psmb3Q9R1P1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Psmb3Q9R1P1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Psmb3Q9R1P1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Psmb3Q9R1P1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psmb3Q9R1P1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Psmb3Q9R1P1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psmb3Q9R1P1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psmb3Q9R1P1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psmb3Q9R1P1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psmb3Q9R1P1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psmb3Q9R1P1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psmb3Q9R1P1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psmb3Q9R1P1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Psmb3Q9R1P1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Psmb3Q9R1P1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Psmb3Q9R1P1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Psmb3Q9R1P1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Psmb3Q9R1P1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Psmb3Q9R1P1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Psmb3Q9R1P1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Psmb3Q9R1P1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Psmb3Q9R1P1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psmb3Q9R1P1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Psmb3Q9R1P1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psmb3Q9R1P1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psmb3Q9R1P1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psmb3Q9R1P1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psmb3Q9R1P1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Psmb3Q9R1P1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psmb3Q9R1P1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psmb3Q9R1P1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psmb3Q9R1P1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psmb3Q9R1P1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psmb3Q9R1P1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psmb3Q9R1P1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psmb3Q9R1P1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psmb3Q9R1P1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psmb3Q9R1P1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psmb3Q9R1P1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psmb3Q9R1P1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psmb3Q9R1P1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psmb3Q9R1P1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psmb3Q9R1P1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psmb3Q9R1P1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psmb3Q9R1P1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psmb3Q9R1P1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psmb3Q9R1P1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psmb3Q9R1P1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psmb3Q9R1P1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psmb3Q9R1P1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psmb3Q9R1P1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psmb3Q9R1P1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psmb3Q9R1P1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psmb3Q9R1P1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psmb3Q9R1P1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psmb3Q9R1P1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psmb3Q9R1P1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psmb3Q9R1P1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psmb3Q9R1P1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Psmb3Q9R1P1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psmb3Q9R1P1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psmb3Q9R1P1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psmb3Q9R1P1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psmb3Q9R1P1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psmb3Q9R1P1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psmb3Q9R1P1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psmb3Q9R1P1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psmb3Q9R1P1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psmb3Q9R1P1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psmb3Q9R1P1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psmb3Q9R1P1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psmb3Q9R1P1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psmb3Q9R1P1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Psmb3Q9R1P1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Psmb3Q9R1P1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Psmb3Q9R1P1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Psmb3Q9R1P1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Psmb3Q9R1P1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psmb3Q9R1P1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psmb3Q9R1P1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psmb3Q9R1P1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Psmb3Q9R1P1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psmb3Q9R1P1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psmb3Q9R1P1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psmb3Q9R1P1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psmb3Q9R1P1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms