Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psma4Q9R1P0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psma4Q9R1P0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psma4Q9R1P0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psma4Q9R1P0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Psma4Q9R1P0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Psma4Q9R1P0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Psma4Q9R1P0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Psma4Q9R1P0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Psma4Q9R1P0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Psma4Q9R1P0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Psma4Q9R1P0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Psma4Q9R1P0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Psma4Q9R1P0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Psma4Q9R1P0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Psma4Q9R1P0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Psma4Q9R1P0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Psma4Q9R1P0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Psma4Q9R1P0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Psma4Q9R1P0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Psma4Q9R1P0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Psma4Q9R1P0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Psma4Q9R1P0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Psma4Q9R1P0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Psma4Q9R1P0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Psma4Q9R1P0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Psma4Q9R1P0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Psma4Q9R1P0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Psma4Q9R1P0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Psma4Q9R1P0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Psma4Q9R1P0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Psma4Q9R1P0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Psma4Q9R1P0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Psma4Q9R1P0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Psma4Q9R1P0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Psma4Q9R1P0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Psma4Q9R1P0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Psma4Q9R1P0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Psma4Q9R1P0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Psma4Q9R1P0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Psma4Q9R1P0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Psma4Q9R1P0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Psma4Q9R1P0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Psma4Q9R1P0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Psma4Q9R1P0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Psma4Q9R1P0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Psma4Q9R1P0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psma4Q9R1P0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psma4Q9R1P0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psma4Q9R1P0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psma4Q9R1P0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psma4Q9R1P0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Psma4Q9R1P0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psma4Q9R1P0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psma4Q9R1P0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psma4Q9R1P0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psma4Q9R1P0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psma4Q9R1P0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psma4Q9R1P0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Psma4Q9R1P0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psma4Q9R1P0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Psma4Q9R1P0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psma4Q9R1P0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psma4Q9R1P0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Psma4Q9R1P0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Psma4Q9R1P0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Psma4Q9R1P0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psma4Q9R1P0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Psma4Q9R1P0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Psma4Q9R1P0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Psma4Q9R1P0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Psma4Q9R1P0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Psma4Q9R1P0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Psma4Q9R1P0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Psma4Q9R1P0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Psma4Q9R1P0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Psma4Q9R1P0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Psma4Q9R1P0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Psma4Q9R1P0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Psma4Q9R1P0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Psma4Q9R1P0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Psma4Q9R1P0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Psma4Q9R1P0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Psma4Q9R1P0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Psma4Q9R1P0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Psma4Q9R1P0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Psma4Q9R1P0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Psma4Q9R1P0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Psma4Q9R1P0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Psma4Q9R1P0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psma4Q9R1P0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Psma4Q9R1P0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Psma4Q9R1P0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Psma4Q9R1P0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psma4Q9R1P0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psma4Q9R1P0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psma4Q9R1P0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psma4Q9R1P0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psma4Q9R1P0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psma4Q9R1P0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms