Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0L9

Cd164, Sialomucin core protein 24, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd164Q9R0L9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd164Q9R0L9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd164Q9R0L9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd164Q9R0L9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd164Q9R0L9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd164Q9R0L9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd164Q9R0L9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd164Q9R0L9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd164Q9R0L9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd164Q9R0L9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd164Q9R0L9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd164Q9R0L9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd164Q9R0L9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd164Q9R0L9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd164Q9R0L9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd164Q9R0L9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd164Q9R0L9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd164Q9R0L9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd164Q9R0L9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd164Q9R0L9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd164Q9R0L9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd164Q9R0L9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd164Q9R0L9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd164Q9R0L9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd164Q9R0L9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cd164Q9R0L9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd164Q9R0L9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd164Q9R0L9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd164Q9R0L9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cd164Q9R0L9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd164Q9R0L9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd164Q9R0L9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd164Q9R0L9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd164Q9R0L9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd164Q9R0L9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd164Q9R0L9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd164Q9R0L9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd164Q9R0L9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd164Q9R0L9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd164Q9R0L9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd164Q9R0L9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd164Q9R0L9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd164Q9R0L9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd164Q9R0L9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd164Q9R0L9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd164Q9R0L9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd164Q9R0L9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd164Q9R0L9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd164Q9R0L9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd164Q9R0L9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd164Q9R0L9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd164Q9R0L9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd164Q9R0L9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd164Q9R0L9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd164Q9R0L9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd164Q9R0L9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd164Q9R0L9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd164Q9R0L9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd164Q9R0L9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd164Q9R0L9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd164Q9R0L9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd164Q9R0L9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd164Q9R0L9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd164Q9R0L9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd164Q9R0L9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd164Q9R0L9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd164Q9R0L9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd164Q9R0L9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd164Q9R0L9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd164Q9R0L9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd164Q9R0L9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd164Q9R0L9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd164Q9R0L9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd164Q9R0L9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd164Q9R0L9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd164Q9R0L9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd164Q9R0L9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd164Q9R0L9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd164Q9R0L9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd164Q9R0L9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd164Q9R0L9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd164Q9R0L9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd164Q9R0L9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd164Q9R0L9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd164Q9R0L9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd164Q9R0L9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd164Q9R0L9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd164Q9R0L9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd164Q9R0L9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd164Q9R0L9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd164Q9R0L9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd164Q9R0L9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd164Q9R0L9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd164Q9R0L9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd164Q9R0L9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd164Q9R0L9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd164Q9R0L9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd164Q9R0L9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd164Q9R0L9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd164Q9R0L9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms