Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS7

Nphs1, Nephrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphs1Q9QZS7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nphs1Q9QZS7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nphs1Q9QZS7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nphs1Q9QZS7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nphs1Q9QZS7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nphs1Q9QZS7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nphs1Q9QZS7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nphs1Q9QZS7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nphs1Q9QZS7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nphs1Q9QZS7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nphs1Q9QZS7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Nphs1Q9QZS7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nphs1Q9QZS7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nphs1Q9QZS7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nphs1Q9QZS7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nphs1Q9QZS7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nphs1Q9QZS7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Nphs1Q9QZS7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nphs1Q9QZS7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Nphs1Q9QZS7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nphs1Q9QZS7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nphs1Q9QZS7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nphs1Q9QZS7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nphs1Q9QZS7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nphs1Q9QZS7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nphs1Q9QZS7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nphs1Q9QZS7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nphs1Q9QZS7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nphs1Q9QZS7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nphs1Q9QZS7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nphs1Q9QZS7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Nphs1Q9QZS7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nphs1Q9QZS7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nphs1Q9QZS7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nphs1Q9QZS7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nphs1Q9QZS7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nphs1Q9QZS7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Nphs1Q9QZS7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Nphs1Q9QZS7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nphs1Q9QZS7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nphs1Q9QZS7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nphs1Q9QZS7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nphs1Q9QZS7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nphs1Q9QZS7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Nphs1Q9QZS7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nphs1Q9QZS7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nphs1Q9QZS7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nphs1Q9QZS7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nphs1Q9QZS7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nphs1Q9QZS7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nphs1Q9QZS7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nphs1Q9QZS7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nphs1Q9QZS7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nphs1Q9QZS7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nphs1Q9QZS7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nphs1Q9QZS7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nphs1Q9QZS7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Nphs1Q9QZS7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Nphs1Q9QZS7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nphs1Q9QZS7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nphs1Q9QZS7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nphs1Q9QZS7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nphs1Q9QZS7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nphs1Q9QZS7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nphs1Q9QZS7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nphs1Q9QZS7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nphs1Q9QZS7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nphs1Q9QZS7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nphs1Q9QZS7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nphs1Q9QZS7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nphs1Q9QZS7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nphs1Q9QZS7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nphs1Q9QZS7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nphs1Q9QZS7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nphs1Q9QZS7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Nphs1Q9QZS7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nphs1Q9QZS7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nphs1Q9QZS7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Nphs1Q9QZS7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nphs1Q9QZS7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Nphs1Q9QZS7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nphs1Q9QZS7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nphs1Q9QZS7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nphs1Q9QZS7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nphs1Q9QZS7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nphs1Q9QZS7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nphs1Q9QZS7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Nphs1Q9QZS7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nphs1Q9QZS7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Nphs1Q9QZS7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nphs1Q9QZS7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nphs1Q9QZS7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nphs1Q9QZS7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nphs1Q9QZS7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nphs1Q9QZS7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nphs1Q9QZS7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nphs1Q9QZS7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nphs1Q9QZS7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nphs1Q9QZS7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nphs1Q9QZS7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms