Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Col4a3Q9QZS0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Col4a3Q9QZS0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Col4a3Q9QZS0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Col4a3Q9QZS0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Col4a3Q9QZS0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Col4a3Q9QZS0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Col4a3Q9QZS0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Col4a3Q9QZS0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Col4a3Q9QZS0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Col4a3Q9QZS0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Col4a3Q9QZS0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Col4a3Q9QZS0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Col4a3Q9QZS0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Col4a3Q9QZS0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Col4a3Q9QZS0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Col4a3Q9QZS0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Col4a3Q9QZS0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Col4a3Q9QZS0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Col4a3Q9QZS0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Col4a3Q9QZS0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Col4a3Q9QZS0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Col4a3Q9QZS0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Col4a3Q9QZS0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Col4a3Q9QZS0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Col4a3Q9QZS0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Col4a3Q9QZS0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Col4a3Q9QZS0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Col4a3Q9QZS0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Col4a3Q9QZS0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Col4a3Q9QZS0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Col4a3Q9QZS0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Col4a3Q9QZS0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Col4a3Q9QZS0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Col4a3Q9QZS0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Col4a3Q9QZS0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Col4a3Q9QZS0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Col4a3Q9QZS0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Col4a3Q9QZS0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Col4a3Q9QZS0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Col4a3Q9QZS0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Col4a3Q9QZS0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Col4a3Q9QZS0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Col4a3Q9QZS0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Col4a3Q9QZS0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Col4a3Q9QZS0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Col4a3Q9QZS0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Col4a3Q9QZS0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Col4a3Q9QZS0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Col4a3Q9QZS0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Col4a3Q9QZS0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Col4a3Q9QZS0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Col4a3Q9QZS0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Col4a3Q9QZS0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Col4a3Q9QZS0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Col4a3Q9QZS0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Col4a3Q9QZS0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Col4a3Q9QZS0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Col4a3Q9QZS0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Col4a3Q9QZS0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Col4a3Q9QZS0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Col4a3Q9QZS0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Col4a3Q9QZS0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Col4a3Q9QZS0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Col4a3Q9QZS0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Col4a3Q9QZS0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Col4a3Q9QZS0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Col4a3Q9QZS0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Col4a3Q9QZS0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Col4a3Q9QZS0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Col4a3Q9QZS0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Col4a3Q9QZS0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Col4a3Q9QZS0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Col4a3Q9QZS0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Col4a3Q9QZS0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Col4a3Q9QZS0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Col4a3Q9QZS0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Col4a3Q9QZS0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Col4a3Q9QZS0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Col4a3Q9QZS0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Col4a3Q9QZS0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Col4a3Q9QZS0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Col4a3Q9QZS0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Col4a3Q9QZS0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Col4a3Q9QZS0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Col4a3Q9QZS0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Col4a3Q9QZS0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Col4a3Q9QZS0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Col4a3Q9QZS0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Col4a3Q9QZS0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Col4a3Q9QZS0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Col4a3Q9QZS0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Col4a3Q9QZS0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Col4a3Q9QZS0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Col4a3Q9QZS0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Col4a3Q9QZS0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Col4a3Q9QZS0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Col4a3Q9QZS0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Col4a3Q9QZS0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Col4a3Q9QZS0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms