Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYI7

Dnajb8, DnaJ homolog subfamily B member 8, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajb8Q9QYI7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Dnajb8Q9QYI7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Dnajb8Q9QYI7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Dnajb8Q9QYI7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Dnajb8Q9QYI7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Dnajb8Q9QYI7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dnajb8Q9QYI7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dnajb8Q9QYI7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Dnajb8Q9QYI7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dnajb8Q9QYI7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dnajb8Q9QYI7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dnajb8Q9QYI7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dnajb8Q9QYI7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dnajb8Q9QYI7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Dnajb8Q9QYI7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Dnajb8Q9QYI7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Dnajb8Q9QYI7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dnajb8Q9QYI7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dnajb8Q9QYI7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dnajb8Q9QYI7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dnajb8Q9QYI7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dnajb8Q9QYI7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dnajb8Q9QYI7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Dnajb8Q9QYI7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dnajb8Q9QYI7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dnajb8Q9QYI7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dnajb8Q9QYI7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dnajb8Q9QYI7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Dnajb8Q9QYI7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Dnajb8Q9QYI7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Dnajb8Q9QYI7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Dnajb8Q9QYI7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Dnajb8Q9QYI7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Dnajb8Q9QYI7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Dnajb8Q9QYI7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Dnajb8Q9QYI7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Dnajb8Q9QYI7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Dnajb8Q9QYI7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Dnajb8Q9QYI7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Dnajb8Q9QYI7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Dnajb8Q9QYI7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Dnajb8Q9QYI7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Dnajb8Q9QYI7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Dnajb8Q9QYI7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dnajb8Q9QYI7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dnajb8Q9QYI7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dnajb8Q9QYI7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dnajb8Q9QYI7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dnajb8Q9QYI7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Dnajb8Q9QYI7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Dnajb8Q9QYI7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Dnajb8Q9QYI7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Dnajb8Q9QYI7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Dnajb8Q9QYI7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Dnajb8Q9QYI7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Dnajb8Q9QYI7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dnajb8Q9QYI7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Dnajb8Q9QYI7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Dnajb8Q9QYI7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Dnajb8Q9QYI7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dnajb8Q9QYI7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dnajb8Q9QYI7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dnajb8Q9QYI7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dnajb8Q9QYI7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dnajb8Q9QYI7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dnajb8Q9QYI7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Dnajb8Q9QYI7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Dnajb8Q9QYI7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dnajb8Q9QYI7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dnajb8Q9QYI7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dnajb8Q9QYI7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dnajb8Q9QYI7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dnajb8Q9QYI7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dnajb8Q9QYI7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dnajb8Q9QYI7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dnajb8Q9QYI7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dnajb8Q9QYI7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Dnajb8Q9QYI7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Dnajb8Q9QYI7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Dnajb8Q9QYI7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Dnajb8Q9QYI7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Dnajb8Q9QYI7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dnajb8Q9QYI7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dnajb8Q9QYI7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dnajb8Q9QYI7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dnajb8Q9QYI7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dnajb8Q9QYI7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dnajb8Q9QYI7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dnajb8Q9QYI7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dnajb8Q9QYI7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dnajb8Q9QYI7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dnajb8Q9QYI7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dnajb8Q9QYI7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dnajb8Q9QYI7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dnajb8Q9QYI7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dnajb8Q9QYI7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dnajb8Q9QYI7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dnajb8Q9QYI7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dnajb8Q9QYI7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dnajb8Q9QYI7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms