Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYE3

Bcl11a, B-cell lymphoma/leukemia 11A, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11aQ9QYE3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Bcl11aQ9QYE3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Bcl11aQ9QYE3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Bcl11aQ9QYE3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Bcl11aQ9QYE3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Bcl11aQ9QYE3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Bcl11aQ9QYE3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Bcl11aQ9QYE3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Bcl11aQ9QYE3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Bcl11aQ9QYE3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Bcl11aQ9QYE3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Bcl11aQ9QYE3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Bcl11aQ9QYE3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Bcl11aQ9QYE3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Bcl11aQ9QYE3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Bcl11aQ9QYE3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Bcl11aQ9QYE3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Bcl11aQ9QYE3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Bcl11aQ9QYE3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Bcl11aQ9QYE3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Bcl11aQ9QYE3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Bcl11aQ9QYE3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Bcl11aQ9QYE3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Bcl11aQ9QYE3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Bcl11aQ9QYE3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Bcl11aQ9QYE3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Bcl11aQ9QYE3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Bcl11aQ9QYE3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Bcl11aQ9QYE3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Bcl11aQ9QYE3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Bcl11aQ9QYE3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Bcl11aQ9QYE3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Bcl11aQ9QYE3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Bcl11aQ9QYE3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Bcl11aQ9QYE3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Bcl11aQ9QYE3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Bcl11aQ9QYE3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Bcl11aQ9QYE3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Bcl11aQ9QYE3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Bcl11aQ9QYE3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Bcl11aQ9QYE3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Bcl11aQ9QYE3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Bcl11aQ9QYE3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Bcl11aQ9QYE3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Bcl11aQ9QYE3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Bcl11aQ9QYE3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Bcl11aQ9QYE3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
Bcl11aQ9QYE3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Bcl11aQ9QYE3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Bcl11aQ9QYE3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Bcl11aQ9QYE3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Bcl11aQ9QYE3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Bcl11aQ9QYE3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Bcl11aQ9QYE3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Bcl11aQ9QYE3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Bcl11aQ9QYE3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Bcl11aQ9QYE3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Bcl11aQ9QYE3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Bcl11aQ9QYE3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Bcl11aQ9QYE3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Bcl11aQ9QYE3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Bcl11aQ9QYE3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Bcl11aQ9QYE3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Bcl11aQ9QYE3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Bcl11aQ9QYE3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Bcl11aQ9QYE3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Bcl11aQ9QYE3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Bcl11aQ9QYE3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Bcl11aQ9QYE3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Bcl11aQ9QYE3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Bcl11aQ9QYE3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Bcl11aQ9QYE3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Bcl11aQ9QYE3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Bcl11aQ9QYE3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Bcl11aQ9QYE3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Bcl11aQ9QYE3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Bcl11aQ9QYE3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Bcl11aQ9QYE3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Bcl11aQ9QYE3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Bcl11aQ9QYE3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Bcl11aQ9QYE3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Bcl11aQ9QYE3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Bcl11aQ9QYE3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Bcl11aQ9QYE3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Bcl11aQ9QYE3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Bcl11aQ9QYE3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Bcl11aQ9QYE3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Bcl11aQ9QYE3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Bcl11aQ9QYE3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Bcl11aQ9QYE3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Bcl11aQ9QYE3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Bcl11aQ9QYE3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Bcl11aQ9QYE3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Bcl11aQ9QYE3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Bcl11aQ9QYE3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Bcl11aQ9QYE3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Bcl11aQ9QYE3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Bcl11aQ9QYE3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Bcl11aQ9QYE3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Bcl11aQ9QYE3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms