Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYA2

Tomm40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm40Q9QYA2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tomm40Q9QYA2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tomm40Q9QYA2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tomm40Q9QYA2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tomm40Q9QYA2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tomm40Q9QYA2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Tomm40Q9QYA2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tomm40Q9QYA2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tomm40Q9QYA2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tomm40Q9QYA2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tomm40Q9QYA2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tomm40Q9QYA2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tomm40Q9QYA2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tomm40Q9QYA2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tomm40Q9QYA2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tomm40Q9QYA2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tomm40Q9QYA2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tomm40Q9QYA2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tomm40Q9QYA2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tomm40Q9QYA2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tomm40Q9QYA2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tomm40Q9QYA2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tomm40Q9QYA2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tomm40Q9QYA2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tomm40Q9QYA2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tomm40Q9QYA2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tomm40Q9QYA2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tomm40Q9QYA2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tomm40Q9QYA2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tomm40Q9QYA2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tomm40Q9QYA2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tomm40Q9QYA2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tomm40Q9QYA2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tomm40Q9QYA2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tomm40Q9QYA2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tomm40Q9QYA2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tomm40Q9QYA2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tomm40Q9QYA2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tomm40Q9QYA2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tomm40Q9QYA2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tomm40Q9QYA2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tomm40Q9QYA2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tomm40Q9QYA2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tomm40Q9QYA2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tomm40Q9QYA2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tomm40Q9QYA2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tomm40Q9QYA2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tomm40Q9QYA2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tomm40Q9QYA2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tomm40Q9QYA2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tomm40Q9QYA2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tomm40Q9QYA2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tomm40Q9QYA2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tomm40Q9QYA2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tomm40Q9QYA2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tomm40Q9QYA2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tomm40Q9QYA2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tomm40Q9QYA2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tomm40Q9QYA2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tomm40Q9QYA2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tomm40Q9QYA2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tomm40Q9QYA2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tomm40Q9QYA2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tomm40Q9QYA2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tomm40Q9QYA2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tomm40Q9QYA2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tomm40Q9QYA2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tomm40Q9QYA2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tomm40Q9QYA2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tomm40Q9QYA2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tomm40Q9QYA2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tomm40Q9QYA2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tomm40Q9QYA2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tomm40Q9QYA2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tomm40Q9QYA2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Tomm40Q9QYA2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tomm40Q9QYA2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tomm40Q9QYA2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tomm40Q9QYA2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Tomm40Q9QYA2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tomm40Q9QYA2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tomm40Q9QYA2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tomm40Q9QYA2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tomm40Q9QYA2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tomm40Q9QYA2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tomm40Q9QYA2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tomm40Q9QYA2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tomm40Q9QYA2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tomm40Q9QYA2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tomm40Q9QYA2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tomm40Q9QYA2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tomm40Q9QYA2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tomm40Q9QYA2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tomm40Q9QYA2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tomm40Q9QYA2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tomm40Q9QYA2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tomm40Q9QYA2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tomm40Q9QYA2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tomm40Q9QYA2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tomm40Q9QYA2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms