Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Irx4Q9QY61 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Irx4Q9QY61 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Irx4Q9QY61 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Irx4Q9QY61 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Irx4Q9QY61 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Irx4Q9QY61 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Irx4Q9QY61 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Irx4Q9QY61 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Irx4Q9QY61 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Irx4Q9QY61 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Irx4Q9QY61 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Irx4Q9QY61 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Irx4Q9QY61 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Irx4Q9QY61 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Irx4Q9QY61 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Irx4Q9QY61 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Irx4Q9QY61 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Irx4Q9QY61 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Irx4Q9QY61 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Irx4Q9QY61 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Irx4Q9QY61 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Irx4Q9QY61 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Irx4Q9QY61 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Irx4Q9QY61 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Irx4Q9QY61 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Irx4Q9QY61 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Irx4Q9QY61 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Irx4Q9QY61 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Irx4Q9QY61 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Irx4Q9QY61 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Irx4Q9QY61 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Irx4Q9QY61 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Irx4Q9QY61 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Irx4Q9QY61 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Irx4Q9QY61 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Irx4Q9QY61 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Irx4Q9QY61 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Irx4Q9QY61 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Irx4Q9QY61 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Irx4Q9QY61 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Irx4Q9QY61 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Irx4Q9QY61 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Irx4Q9QY61 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Irx4Q9QY61 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Irx4Q9QY61 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Irx4Q9QY61 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Irx4Q9QY61 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Irx4Q9QY61 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Irx4Q9QY61 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Irx4Q9QY61 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Irx4Q9QY61 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Irx4Q9QY61 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Irx4Q9QY61 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Irx4Q9QY61 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Irx4Q9QY61 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Irx4Q9QY61 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Irx4Q9QY61 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Irx4Q9QY61 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Irx4Q9QY61 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Irx4Q9QY61 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Irx4Q9QY61 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Irx4Q9QY61 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Irx4Q9QY61 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Irx4Q9QY61 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Irx4Q9QY61 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Irx4Q9QY61 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Irx4Q9QY61 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Irx4Q9QY61 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Irx4Q9QY61 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Irx4Q9QY61 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Irx4Q9QY61 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Irx4Q9QY61 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Irx4Q9QY61 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Irx4Q9QY61 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Irx4Q9QY61 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Irx4Q9QY61 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Irx4Q9QY61 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Irx4Q9QY61 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Irx4Q9QY61 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Irx4Q9QY61 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Irx4Q9QY61 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Irx4Q9QY61 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Irx4Q9QY61 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Irx4Q9QY61 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Irx4Q9QY61 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Irx4Q9QY61 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Irx4Q9QY61 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Irx4Q9QY61 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Irx4Q9QY61 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Irx4Q9QY61 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Irx4Q9QY61 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Irx4Q9QY61 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Irx4Q9QY61 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Irx4Q9QY61 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Irx4Q9QY61 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Irx4Q9QY61 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Irx4Q9QY61 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Irx4Q9QY61 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Irx4Q9QY61 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms