Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX96

Sall2, Sal-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall2Q9QX96 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Sall2Q9QX96 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
Sall2Q9QX96 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Sall2Q9QX96 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Sall2Q9QX96 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Sall2Q9QX96 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Sall2Q9QX96 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Sall2Q9QX96 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Sall2Q9QX96 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Sall2Q9QX96 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Sall2Q9QX96 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Sall2Q9QX96 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Sall2Q9QX96 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Sall2Q9QX96 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Sall2Q9QX96 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Sall2Q9QX96 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Sall2Q9QX96 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Sall2Q9QX96 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Sall2Q9QX96 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
Sall2Q9QX96 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Sall2Q9QX96 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Sall2Q9QX96 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Sall2Q9QX96 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
Sall2Q9QX96 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Sall2Q9QX96 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Sall2Q9QX96 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Sall2Q9QX96 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Sall2Q9QX96 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Sall2Q9QX96 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Sall2Q9QX96 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Sall2Q9QX96 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Sall2Q9QX96 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Sall2Q9QX96 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Sall2Q9QX96 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
Sall2Q9QX96 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Sall2Q9QX96 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
Sall2Q9QX96 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Sall2Q9QX96 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Sall2Q9QX96 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Sall2Q9QX96 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
Sall2Q9QX96 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Sall2Q9QX96 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Sall2Q9QX96 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Sall2Q9QX96 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Sall2Q9QX96 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
Sall2Q9QX96 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Sall2Q9QX96 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Sall2Q9QX96 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Sall2Q9QX96 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Sall2Q9QX96 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Sall2Q9QX96 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Sall2Q9QX96 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Sall2Q9QX96 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC34.76■■■■□ 3.15
Sall2Q9QX96 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Sall2Q9QX96 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Sall2Q9QX96 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Sall2Q9QX96 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
Sall2Q9QX96 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Sall2Q9QX96 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Sall2Q9QX96 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Sall2Q9QX96 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Sall2Q9QX96 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Sall2Q9QX96 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Sall2Q9QX96 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Sall2Q9QX96 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Sall2Q9QX96 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Sall2Q9QX96 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Sall2Q9QX96 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Sall2Q9QX96 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Sall2Q9QX96 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Sall2Q9QX96 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Sall2Q9QX96 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
Sall2Q9QX96 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Sall2Q9QX96 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Sall2Q9QX96 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Sall2Q9QX96 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Sall2Q9QX96 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Sall2Q9QX96 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Sall2Q9QX96 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Sall2Q9QX96 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Sall2Q9QX96 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Sall2Q9QX96 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Sall2Q9QX96 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Sall2Q9QX96 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Sall2Q9QX96 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Sall2Q9QX96 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Sall2Q9QX96 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Sall2Q9QX96 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Sall2Q9QX96 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Sall2Q9QX96 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Sall2Q9QX96 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Sall2Q9QX96 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Sall2Q9QX96 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Sall2Q9QX96 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC34.51■■■■□ 3.12
Sall2Q9QX96 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
Sall2Q9QX96 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Sall2Q9QX96 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Sall2Q9QX96 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Sall2Q9QX96 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Sall2Q9QX96 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms