Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM9

Psma6, Proteasome subunit alpha type-6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma6Q9QUM9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Psma6Q9QUM9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Psma6Q9QUM9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Psma6Q9QUM9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Psma6Q9QUM9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Psma6Q9QUM9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Psma6Q9QUM9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Psma6Q9QUM9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Psma6Q9QUM9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Psma6Q9QUM9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Psma6Q9QUM9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Psma6Q9QUM9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Psma6Q9QUM9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Psma6Q9QUM9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Psma6Q9QUM9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Psma6Q9QUM9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Psma6Q9QUM9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Psma6Q9QUM9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Psma6Q9QUM9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Psma6Q9QUM9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Psma6Q9QUM9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Psma6Q9QUM9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Psma6Q9QUM9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Psma6Q9QUM9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Psma6Q9QUM9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Psma6Q9QUM9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Psma6Q9QUM9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Psma6Q9QUM9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Psma6Q9QUM9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Psma6Q9QUM9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Psma6Q9QUM9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Psma6Q9QUM9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Psma6Q9QUM9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Psma6Q9QUM9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Psma6Q9QUM9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Psma6Q9QUM9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Psma6Q9QUM9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Psma6Q9QUM9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Psma6Q9QUM9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Psma6Q9QUM9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Psma6Q9QUM9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Psma6Q9QUM9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Psma6Q9QUM9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Psma6Q9QUM9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Psma6Q9QUM9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Psma6Q9QUM9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Psma6Q9QUM9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Psma6Q9QUM9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Psma6Q9QUM9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Psma6Q9QUM9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Psma6Q9QUM9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Psma6Q9QUM9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Psma6Q9QUM9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Psma6Q9QUM9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Psma6Q9QUM9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Psma6Q9QUM9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Psma6Q9QUM9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Psma6Q9QUM9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Psma6Q9QUM9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Psma6Q9QUM9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Psma6Q9QUM9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Psma6Q9QUM9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Psma6Q9QUM9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Psma6Q9QUM9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Psma6Q9QUM9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Psma6Q9QUM9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Psma6Q9QUM9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psma6Q9QUM9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psma6Q9QUM9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psma6Q9QUM9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psma6Q9QUM9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Psma6Q9QUM9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psma6Q9QUM9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psma6Q9QUM9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psma6Q9QUM9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psma6Q9QUM9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psma6Q9QUM9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Psma6Q9QUM9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Psma6Q9QUM9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Psma6Q9QUM9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psma6Q9QUM9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Psma6Q9QUM9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Psma6Q9QUM9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Psma6Q9QUM9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Psma6Q9QUM9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Psma6Q9QUM9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Psma6Q9QUM9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Psma6Q9QUM9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Psma6Q9QUM9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Psma6Q9QUM9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Psma6Q9QUM9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Psma6Q9QUM9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Psma6Q9QUM9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Psma6Q9QUM9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Psma6Q9QUM9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Psma6Q9QUM9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Psma6Q9QUM9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Psma6Q9QUM9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psma6Q9QUM9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psma6Q9QUM9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms