Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL13Q9P2N7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHL13Q9P2N7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHL13Q9P2N7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHL13Q9P2N7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHL13Q9P2N7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL13Q9P2N7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL13Q9P2N7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL13Q9P2N7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
KLHL13Q9P2N7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHL13Q9P2N7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL13Q9P2N7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHL13Q9P2N7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHL13Q9P2N7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL13Q9P2N7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL13Q9P2N7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL13Q9P2N7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL13Q9P2N7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL13Q9P2N7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL13Q9P2N7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL13Q9P2N7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL13Q9P2N7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL13Q9P2N7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL13Q9P2N7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL13Q9P2N7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL13Q9P2N7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL13Q9P2N7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KLHL13Q9P2N7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLHL13Q9P2N7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
KLHL13Q9P2N7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLHL13Q9P2N7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLHL13Q9P2N7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLHL13Q9P2N7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLHL13Q9P2N7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHL13Q9P2N7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL13Q9P2N7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL13Q9P2N7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL13Q9P2N7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL13Q9P2N7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL13Q9P2N7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL13Q9P2N7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHL13Q9P2N7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHL13Q9P2N7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHL13Q9P2N7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL13Q9P2N7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL13Q9P2N7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL13Q9P2N7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL13Q9P2N7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL13Q9P2N7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL13Q9P2N7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL13Q9P2N7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL13Q9P2N7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL13Q9P2N7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL13Q9P2N7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL13Q9P2N7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL13Q9P2N7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL13Q9P2N7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL13Q9P2N7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL13Q9P2N7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL13Q9P2N7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL13Q9P2N7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL13Q9P2N7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL13Q9P2N7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL13Q9P2N7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL13Q9P2N7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL13Q9P2N7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL13Q9P2N7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL13Q9P2N7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL13Q9P2N7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL13Q9P2N7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL13Q9P2N7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL13Q9P2N7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL13Q9P2N7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL13Q9P2N7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL13Q9P2N7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL13Q9P2N7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL13Q9P2N7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL13Q9P2N7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL13Q9P2N7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL13Q9P2N7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL13Q9P2N7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL13Q9P2N7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL13Q9P2N7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL13Q9P2N7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL13Q9P2N7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
KLHL13Q9P2N7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHL13Q9P2N7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHL13Q9P2N7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHL13Q9P2N7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHL13Q9P2N7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL13Q9P2N7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL13Q9P2N7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL13Q9P2N7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL13Q9P2N7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL13Q9P2N7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL13Q9P2N7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL13Q9P2N7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL13Q9P2N7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL13Q9P2N7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL13Q9P2N7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms