Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2A4

ABI3, ABI gene family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABI3Q9P2A4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABI3Q9P2A4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABI3Q9P2A4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABI3Q9P2A4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABI3Q9P2A4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ABI3Q9P2A4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ABI3Q9P2A4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ABI3Q9P2A4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ABI3Q9P2A4 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ABI3Q9P2A4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ABI3Q9P2A4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ABI3Q9P2A4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABI3Q9P2A4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABI3Q9P2A4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABI3Q9P2A4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABI3Q9P2A4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABI3Q9P2A4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABI3Q9P2A4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABI3Q9P2A4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABI3Q9P2A4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABI3Q9P2A4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABI3Q9P2A4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABI3Q9P2A4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABI3Q9P2A4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABI3Q9P2A4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABI3Q9P2A4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ABI3Q9P2A4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABI3Q9P2A4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABI3Q9P2A4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ABI3Q9P2A4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ABI3Q9P2A4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ABI3Q9P2A4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABI3Q9P2A4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABI3Q9P2A4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABI3Q9P2A4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABI3Q9P2A4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABI3Q9P2A4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABI3Q9P2A4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ABI3Q9P2A4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABI3Q9P2A4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABI3Q9P2A4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABI3Q9P2A4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABI3Q9P2A4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABI3Q9P2A4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABI3Q9P2A4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABI3Q9P2A4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABI3Q9P2A4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ABI3Q9P2A4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABI3Q9P2A4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABI3Q9P2A4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABI3Q9P2A4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABI3Q9P2A4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABI3Q9P2A4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABI3Q9P2A4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABI3Q9P2A4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABI3Q9P2A4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABI3Q9P2A4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABI3Q9P2A4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ABI3Q9P2A4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ABI3Q9P2A4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ABI3Q9P2A4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ABI3Q9P2A4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABI3Q9P2A4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABI3Q9P2A4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABI3Q9P2A4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ABI3Q9P2A4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABI3Q9P2A4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABI3Q9P2A4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABI3Q9P2A4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABI3Q9P2A4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABI3Q9P2A4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABI3Q9P2A4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABI3Q9P2A4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABI3Q9P2A4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABI3Q9P2A4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABI3Q9P2A4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABI3Q9P2A4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABI3Q9P2A4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABI3Q9P2A4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ABI3Q9P2A4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABI3Q9P2A4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABI3Q9P2A4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABI3Q9P2A4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABI3Q9P2A4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABI3Q9P2A4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABI3Q9P2A4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ABI3Q9P2A4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABI3Q9P2A4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABI3Q9P2A4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABI3Q9P2A4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABI3Q9P2A4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABI3Q9P2A4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABI3Q9P2A4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABI3Q9P2A4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABI3Q9P2A4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABI3Q9P2A4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ABI3Q9P2A4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ABI3Q9P2A4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ABI3Q9P2A4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABI3Q9P2A4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms