Protein–RNA interactions for Protein: Q9P253

VPS18, Vacuolar protein sorting-associated protein 18 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS18Q9P253 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
VPS18Q9P253 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VPS18Q9P253 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VPS18Q9P253 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
VPS18Q9P253 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
VPS18Q9P253 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
VPS18Q9P253 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
VPS18Q9P253 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
VPS18Q9P253 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
VPS18Q9P253 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VPS18Q9P253 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
VPS18Q9P253 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
VPS18Q9P253 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
VPS18Q9P253 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
VPS18Q9P253 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
VPS18Q9P253 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
VPS18Q9P253 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
VPS18Q9P253 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
VPS18Q9P253 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
VPS18Q9P253 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
VPS18Q9P253 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VPS18Q9P253 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VPS18Q9P253 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
VPS18Q9P253 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
VPS18Q9P253 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
VPS18Q9P253 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
VPS18Q9P253 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
VPS18Q9P253 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
VPS18Q9P253 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
VPS18Q9P253 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
VPS18Q9P253 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
VPS18Q9P253 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
VPS18Q9P253 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
VPS18Q9P253 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
VPS18Q9P253 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
VPS18Q9P253 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
VPS18Q9P253 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
VPS18Q9P253 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
VPS18Q9P253 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
VPS18Q9P253 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
VPS18Q9P253 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
VPS18Q9P253 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
VPS18Q9P253 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
VPS18Q9P253 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
VPS18Q9P253 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
VPS18Q9P253 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
VPS18Q9P253 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
VPS18Q9P253 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
VPS18Q9P253 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
VPS18Q9P253 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
VPS18Q9P253 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
VPS18Q9P253 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
VPS18Q9P253 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
VPS18Q9P253 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
VPS18Q9P253 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
VPS18Q9P253 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
VPS18Q9P253 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
VPS18Q9P253 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
VPS18Q9P253 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
VPS18Q9P253 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
VPS18Q9P253 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
VPS18Q9P253 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
VPS18Q9P253 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
VPS18Q9P253 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
VPS18Q9P253 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
VPS18Q9P253 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
VPS18Q9P253 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
VPS18Q9P253 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
VPS18Q9P253 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
VPS18Q9P253 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
VPS18Q9P253 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
VPS18Q9P253 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
VPS18Q9P253 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
VPS18Q9P253 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
VPS18Q9P253 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
VPS18Q9P253 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VPS18Q9P253 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VPS18Q9P253 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VPS18Q9P253 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
VPS18Q9P253 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
VPS18Q9P253 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
VPS18Q9P253 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
VPS18Q9P253 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
VPS18Q9P253 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
VPS18Q9P253 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
VPS18Q9P253 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VPS18Q9P253 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
VPS18Q9P253 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
VPS18Q9P253 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
VPS18Q9P253 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
VPS18Q9P253 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
VPS18Q9P253 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VPS18Q9P253 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VPS18Q9P253 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
VPS18Q9P253 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VPS18Q9P253 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VPS18Q9P253 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VPS18Q9P253 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VPS18Q9P253 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VPS18Q9P253 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms