Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CNTN3Q9P232 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CNTN3Q9P232 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CNTN3Q9P232 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CNTN3Q9P232 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CNTN3Q9P232 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CNTN3Q9P232 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CNTN3Q9P232 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CNTN3Q9P232 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CNTN3Q9P232 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CNTN3Q9P232 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CNTN3Q9P232 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CNTN3Q9P232 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CNTN3Q9P232 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CNTN3Q9P232 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CNTN3Q9P232 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CNTN3Q9P232 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CNTN3Q9P232 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CNTN3Q9P232 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CNTN3Q9P232 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CNTN3Q9P232 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CNTN3Q9P232 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CNTN3Q9P232 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CNTN3Q9P232 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CNTN3Q9P232 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CNTN3Q9P232 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CNTN3Q9P232 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CNTN3Q9P232 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CNTN3Q9P232 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CNTN3Q9P232 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CNTN3Q9P232 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CNTN3Q9P232 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CNTN3Q9P232 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CNTN3Q9P232 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CNTN3Q9P232 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CNTN3Q9P232 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CNTN3Q9P232 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CNTN3Q9P232 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CNTN3Q9P232 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CNTN3Q9P232 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CNTN3Q9P232 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CNTN3Q9P232 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CNTN3Q9P232 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CNTN3Q9P232 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CNTN3Q9P232 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CNTN3Q9P232 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CNTN3Q9P232 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CNTN3Q9P232 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CNTN3Q9P232 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CNTN3Q9P232 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CNTN3Q9P232 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CNTN3Q9P232 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CNTN3Q9P232 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CNTN3Q9P232 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CNTN3Q9P232 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CNTN3Q9P232 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CNTN3Q9P232 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CNTN3Q9P232 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CNTN3Q9P232 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CNTN3Q9P232 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CNTN3Q9P232 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CNTN3Q9P232 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CNTN3Q9P232 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CNTN3Q9P232 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CNTN3Q9P232 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CNTN3Q9P232 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CNTN3Q9P232 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CNTN3Q9P232 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CNTN3Q9P232 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CNTN3Q9P232 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CNTN3Q9P232 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CNTN3Q9P232 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CNTN3Q9P232 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CNTN3Q9P232 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
CNTN3Q9P232 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CNTN3Q9P232 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CNTN3Q9P232 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CNTN3Q9P232 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CNTN3Q9P232 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CNTN3Q9P232 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CNTN3Q9P232 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CNTN3Q9P232 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CNTN3Q9P232 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CNTN3Q9P232 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CNTN3Q9P232 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CNTN3Q9P232 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CNTN3Q9P232 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CNTN3Q9P232 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CNTN3Q9P232 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CNTN3Q9P232 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CNTN3Q9P232 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CNTN3Q9P232 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CNTN3Q9P232 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CNTN3Q9P232 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CNTN3Q9P232 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CNTN3Q9P232 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CNTN3Q9P232 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CNTN3Q9P232 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CNTN3Q9P232 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CNTN3Q9P232 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms