Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN9

AIPL1, Aryl-hydrocarbon-interacting protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIPL1Q9NZN9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
AIPL1Q9NZN9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
AIPL1Q9NZN9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
AIPL1Q9NZN9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
AIPL1Q9NZN9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
AIPL1Q9NZN9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
AIPL1Q9NZN9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
AIPL1Q9NZN9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
AIPL1Q9NZN9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
AIPL1Q9NZN9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
AIPL1Q9NZN9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
AIPL1Q9NZN9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
AIPL1Q9NZN9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
AIPL1Q9NZN9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
AIPL1Q9NZN9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
AIPL1Q9NZN9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
AIPL1Q9NZN9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
AIPL1Q9NZN9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
AIPL1Q9NZN9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
AIPL1Q9NZN9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
AIPL1Q9NZN9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
AIPL1Q9NZN9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
AIPL1Q9NZN9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
AIPL1Q9NZN9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
AIPL1Q9NZN9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
AIPL1Q9NZN9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
AIPL1Q9NZN9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
AIPL1Q9NZN9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
AIPL1Q9NZN9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
AIPL1Q9NZN9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
AIPL1Q9NZN9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
AIPL1Q9NZN9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
AIPL1Q9NZN9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
AIPL1Q9NZN9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
AIPL1Q9NZN9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
AIPL1Q9NZN9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
AIPL1Q9NZN9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
AIPL1Q9NZN9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
AIPL1Q9NZN9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
AIPL1Q9NZN9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
AIPL1Q9NZN9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
AIPL1Q9NZN9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
AIPL1Q9NZN9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
AIPL1Q9NZN9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
AIPL1Q9NZN9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
AIPL1Q9NZN9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
AIPL1Q9NZN9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
AIPL1Q9NZN9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
AIPL1Q9NZN9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
AIPL1Q9NZN9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
AIPL1Q9NZN9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
AIPL1Q9NZN9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
AIPL1Q9NZN9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
AIPL1Q9NZN9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
AIPL1Q9NZN9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
AIPL1Q9NZN9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
AIPL1Q9NZN9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
AIPL1Q9NZN9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
AIPL1Q9NZN9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
AIPL1Q9NZN9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
AIPL1Q9NZN9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
AIPL1Q9NZN9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
AIPL1Q9NZN9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
AIPL1Q9NZN9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
AIPL1Q9NZN9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
AIPL1Q9NZN9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
AIPL1Q9NZN9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
AIPL1Q9NZN9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
AIPL1Q9NZN9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
AIPL1Q9NZN9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
AIPL1Q9NZN9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
AIPL1Q9NZN9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
AIPL1Q9NZN9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
AIPL1Q9NZN9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
AIPL1Q9NZN9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
AIPL1Q9NZN9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
AIPL1Q9NZN9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
AIPL1Q9NZN9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
AIPL1Q9NZN9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
AIPL1Q9NZN9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
AIPL1Q9NZN9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
AIPL1Q9NZN9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
AIPL1Q9NZN9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
AIPL1Q9NZN9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.12
AIPL1Q9NZN9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
AIPL1Q9NZN9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
AIPL1Q9NZN9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
AIPL1Q9NZN9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
AIPL1Q9NZN9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
AIPL1Q9NZN9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
AIPL1Q9NZN9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
AIPL1Q9NZN9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
AIPL1Q9NZN9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
AIPL1Q9NZN9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
AIPL1Q9NZN9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
AIPL1Q9NZN9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
AIPL1Q9NZN9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
AIPL1Q9NZN9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
AIPL1Q9NZN9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
AIPL1Q9NZN9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms