Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN4

EHD2, EH domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD2Q9NZN4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
EHD2Q9NZN4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
EHD2Q9NZN4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
EHD2Q9NZN4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
EHD2Q9NZN4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
EHD2Q9NZN4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
EHD2Q9NZN4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
EHD2Q9NZN4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
EHD2Q9NZN4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
EHD2Q9NZN4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
EHD2Q9NZN4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
EHD2Q9NZN4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
EHD2Q9NZN4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
EHD2Q9NZN4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
EHD2Q9NZN4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
EHD2Q9NZN4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
EHD2Q9NZN4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
EHD2Q9NZN4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
EHD2Q9NZN4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
EHD2Q9NZN4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
EHD2Q9NZN4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
EHD2Q9NZN4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
EHD2Q9NZN4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
EHD2Q9NZN4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
EHD2Q9NZN4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
EHD2Q9NZN4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
EHD2Q9NZN4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
EHD2Q9NZN4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
EHD2Q9NZN4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
EHD2Q9NZN4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
EHD2Q9NZN4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
EHD2Q9NZN4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
EHD2Q9NZN4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
EHD2Q9NZN4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
EHD2Q9NZN4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
EHD2Q9NZN4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
EHD2Q9NZN4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
EHD2Q9NZN4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
EHD2Q9NZN4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
EHD2Q9NZN4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
EHD2Q9NZN4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
EHD2Q9NZN4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
EHD2Q9NZN4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
EHD2Q9NZN4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
EHD2Q9NZN4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
EHD2Q9NZN4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
EHD2Q9NZN4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
EHD2Q9NZN4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
EHD2Q9NZN4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
EHD2Q9NZN4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
EHD2Q9NZN4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
EHD2Q9NZN4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
EHD2Q9NZN4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
EHD2Q9NZN4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
EHD2Q9NZN4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
EHD2Q9NZN4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
EHD2Q9NZN4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
EHD2Q9NZN4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
EHD2Q9NZN4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
EHD2Q9NZN4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
EHD2Q9NZN4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
EHD2Q9NZN4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
EHD2Q9NZN4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
EHD2Q9NZN4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
EHD2Q9NZN4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
EHD2Q9NZN4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
EHD2Q9NZN4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
EHD2Q9NZN4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
EHD2Q9NZN4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
EHD2Q9NZN4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
EHD2Q9NZN4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
EHD2Q9NZN4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
EHD2Q9NZN4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
EHD2Q9NZN4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
EHD2Q9NZN4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
EHD2Q9NZN4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
EHD2Q9NZN4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
EHD2Q9NZN4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
EHD2Q9NZN4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
EHD2Q9NZN4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
EHD2Q9NZN4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
EHD2Q9NZN4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
EHD2Q9NZN4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
EHD2Q9NZN4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
EHD2Q9NZN4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
EHD2Q9NZN4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
EHD2Q9NZN4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
EHD2Q9NZN4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
EHD2Q9NZN4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
EHD2Q9NZN4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EHD2Q9NZN4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
EHD2Q9NZN4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EHD2Q9NZN4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
EHD2Q9NZN4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EHD2Q9NZN4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
EHD2Q9NZN4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
EHD2Q9NZN4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
EHD2Q9NZN4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
EHD2Q9NZN4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EHD2Q9NZN4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms