Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI8

IGF2BP1, Insulin-like growth factor 2 mRNA-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGF2BP1Q9NZI8 CCNDBP1-215ENST00000569745 1356 ntTSL 516.23■□□□□ 0.191e-12■■■■■ 39.4
IGF2BP1Q9NZI8 CCNDBP1-213ENST00000568507 1385 ntTSL 214.75□□□□□ -0.051e-12■■■■■ 39.4
IGF2BP1Q9NZI8 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.061e-12■■■■■ 39.4
IGF2BP1Q9NZI8 CNOT6L-207ENST00000515441 572 ntTSL 414.64□□□□□ -0.071e-12■■■■■ 39.4
IGF2BP1Q9NZI8 CCNDBP1-206ENST00000565296 1831 ntTSL 213.82□□□□□ -0.21e-12■■■■■ 39.4
IGF2BP1Q9NZI8 CNOT6L-204ENST00000506166 781 ntTSL 210.64□□□□□ -0.711e-12■■■■■ 39.4
IGF2BP1Q9NZI8 CNOT6L-208ENST00000515506 4024 ntTSL 59.92□□□□□ -0.821e-12■■■■■ 39.4
IGF2BP1Q9NZI8 CCNDBP1-202ENST00000444658 1479 ntTSL 29.29□□□□□ -0.921e-12■■■■■ 39.4
IGF2BP1Q9NZI8 TBL1XR1-220ENST00000630796 656 ntTSL 56.71□□□□□ -1.341e-12■■■■■ 39.4
IGF2BP1Q9NZI8 CCNDBP1-207ENST00000565958 750 ntTSL 26.47□□□□□ -1.371e-12■■■■■ 39.4
IGF2BP1Q9NZI8 CNOT6L-202ENST00000504804 1925 ntTSL 56.09□□□□□ -1.431e-12■■■■■ 39.4
IGF2BP1Q9NZI8 CNOT6L-206ENST00000512485 1890 ntTSL 55.74□□□□□ -1.491e-12■■■■■ 39.4
IGF2BP1Q9NZI8 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.841e-12■■■■■ 39.4
IGF2BP1Q9NZI8 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.715e-7■■■■■ 39.4
IGF2BP1Q9NZI8 RTL8A-204ENST00000522309 536 ntTSL 1 (best)16.69■□□□□ 0.265e-7■■■■■ 39.4
IGF2BP1Q9NZI8 RTL8A-203ENST00000520964 817 ntTSL 39.99□□□□□ -0.815e-7■■■■■ 39.4
IGF2BP1Q9NZI8 RTL8A-202ENST00000518153 762 ntTSL 26.04□□□□□ -1.445e-7■■■■■ 39.4
IGF2BP1Q9NZI8 GPC3-203ENST00000406757 836 ntTSL 28.35□□□□□ -1.075e-7■■■■■ 39.3
IGF2BP1Q9NZI8 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.42e-12■■■■■ 39.3
IGF2BP1Q9NZI8 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.312e-12■■■■■ 39.3
IGF2BP1Q9NZI8 ATP5C1-209ENST00000480528 460 ntTSL 24.95□□□□□ -1.628e-17■■■■■ 39.2
IGF2BP1Q9NZI8 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.244e-12■■■■■ 39.2
IGF2BP1Q9NZI8 GYPA-210ENST00000514603 613 ntTSL 56.58□□□□□ -1.361e-14■■■■■ 39.2
IGF2BP1Q9NZI8 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC13.88□□□□□ -0.192e-10■■■■■ 39.1
IGF2BP1Q9NZI8 SNORD3B-1-203ENST00000631292 217 nt11.17□□□□□ -0.622e-10■■■■■ 39.1
IGF2BP1Q9NZI8 SNORD3B-1-202ENST00000617128 218 nt11.11□□□□□ -0.632e-10■■■■■ 39.1
IGF2BP1Q9NZI8 CPD-209ENST00000584221 680 ntTSL 35.8□□□□□ -1.486e-7■■■■■ 39.1
IGF2BP1Q9NZI8 VDAC2-212ENST00000481876 822 ntTSL 316.11■□□□□ 0.173e-7■■■■■ 39
IGF2BP1Q9NZI8 VDAC2-204ENST00000344036 681 ntTSL 314.96□□□□□ -0.013e-7■■■■■ 39
IGF2BP1Q9NZI8 VDAC2-208ENST00000468285 850 ntTSL 214.34□□□□□ -0.113e-7■■■■■ 39
IGF2BP1Q9NZI8 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.881e-8■■■■■ 39
IGF2BP1Q9NZI8 NIPSNAP2-208ENST00000470036 497 ntTSL 219.49■□□□□ 0.717e-9■■■■■ 38.9
IGF2BP1Q9NZI8 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.432e-8■■■■■ 38.9
IGF2BP1Q9NZI8 PSMA1-201ENST00000396394 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.42e-8■■■■■ 38.9
IGF2BP1Q9NZI8 AC018523.2-201ENST00000555531 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.51□□□□□ -1.052e-8■■■■■ 38.9
IGF2BP1Q9NZI8 PSMA1-207ENST00000528307 1394 ntTSL 57.04□□□□□ -1.282e-8■■■■■ 38.9
IGF2BP1Q9NZI8 KPNA3-201ENST00000261667 4474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.685e-12■■■■■ 38.9
IGF2BP1Q9NZI8 KPNA3-202ENST00000436760 588 ntTSL 26.4□□□□□ -1.385e-12■■■■■ 38.9
IGF2BP1Q9NZI8 NUSAP1-211ENST00000560318 485 ntTSL 513.15□□□□□ -0.31e-12■■■■■ 38.8
IGF2BP1Q9NZI8 NUSAP1-213ENST00000560898 708 ntTSL 36.82□□□□□ -1.321e-12■■■■■ 38.8
IGF2BP1Q9NZI8 KDELR2-204ENST00000462052 382 ntTSL 27.85□□□□□ -1.157e-10■■■■■ 38.7
IGF2BP1Q9NZI8 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.271e-15■■■■■ 38.7
IGF2BP1Q9NZI8 TMEM123-205ENST00000528969 568 ntAPPRIS ALT2 TSL 44.69□□□□□ -1.661e-15■■■■■ 38.7
IGF2BP1Q9NZI8 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.534e-7■■■■■ 38.7
IGF2BP1Q9NZI8 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.114e-7■■■■■ 38.7
IGF2BP1Q9NZI8 TAB2-203ENST00000470466 4199 ntTSL 1 (best)6.51□□□□□ -1.374e-7■■■■■ 38.7
IGF2BP1Q9NZI8 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.984e-7■■■■■ 38.7
IGF2BP1Q9NZI8 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.064e-7■■■■■ 38.7
IGF2BP1Q9NZI8 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -01e-11■■■■■ 38.7
IGF2BP1Q9NZI8 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.051e-11■■■■■ 38.7
IGF2BP1Q9NZI8 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.251e-11■■■■■ 38.7
IGF2BP1Q9NZI8 AL132671.2-201ENST00000467125 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.781e-11■■■■■ 38.7
IGF2BP1Q9NZI8 SEC31A-240ENST00000515062 597 ntTSL 36.63□□□□□ -1.352e-9■■■■■ 38.7
IGF2BP1Q9NZI8 RRBP1-206ENST00000455029 2485 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.287e-30■■■■■ 38.6
IGF2BP1Q9NZI8 PSMA1-204ENST00000526443 569 ntTSL 26.68□□□□□ -1.344e-8■■■■■ 38.5
IGF2BP1Q9NZI8 CCNY-207ENST00000490012 793 ntTSL 314.91□□□□□ -0.022e-7■■■■■ 38.5
IGF2BP1Q9NZI8 FKBP1A-206ENST00000460490 694 ntTSL 28.83□□□□□ -14e-9■■■■■ 38.5
IGF2BP1Q9NZI8 FKBP1A-203ENST00000381724 976 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.264e-9■■■■■ 38.5
IGF2BP1Q9NZI8 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.682e-7■■■■■ 38.4
IGF2BP1Q9NZI8 LINC00511-202ENST00000457958 1696 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.382e-7■■■■■ 38.4
IGF2BP1Q9NZI8 LINC00511-210ENST00000580861 467 ntTSL 48.84□□□□□ -0.992e-7■■■■■ 38.4
IGF2BP1Q9NZI8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.062e-12■■■■■ 38.3
IGF2BP1Q9NZI8 CCNG1-207ENST00000510097 564 ntTSL 414.77□□□□□ -0.055e-24■■■■■ 38.3
IGF2BP1Q9NZI8 C1orf174-202ENST00000474140 3499 ntTSL 514.71□□□□□ -0.062e-12■■■■■ 38.3
IGF2BP1Q9NZI8 C1orf174-203ENST00000486765 2517 ntTSL 514.05□□□□□ -0.162e-12■■■■■ 38.3
IGF2BP1Q9NZI8 COPZ1-204ENST00000548281 554 ntTSL 411.65□□□□□ -0.542e-7■■■■■ 38.3
IGF2BP1Q9NZI8 COPZ1-213ENST00000551962 578 ntTSL 511.22□□□□□ -0.612e-7■■■■■ 38.3
IGF2BP1Q9NZI8 COPZ1-208ENST00000550027 553 ntTSL 1 (best)8.72□□□□□ -1.012e-7■■■■■ 38.3
IGF2BP1Q9NZI8 COPZ1-210ENST00000550713 548 ntTSL 28.4□□□□□ -1.062e-7■■■■■ 38.3
IGF2BP1Q9NZI8 COPZ1-215ENST00000552362 575 ntTSL 4 BASIC7.97□□□□□ -1.132e-7■■■■■ 38.3
IGF2BP1Q9NZI8 COPZ1-211ENST00000551412 548 ntTSL 27.9□□□□□ -1.142e-7■■■■■ 38.3
IGF2BP1Q9NZI8 COPZ1-218ENST00000553231 551 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.332e-7■■■■■ 38.3
IGF2BP1Q9NZI8 RAB6A-201ENST00000310653 3389 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.33e-7■■■■■ 38.2
IGF2BP1Q9NZI8 RAB6A-202ENST00000336083 3085 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.453e-7■■■■■ 38.2
IGF2BP1Q9NZI8 PSMA1-211ENST00000531156 574 ntTSL 48.99□□□□□ -0.974e-8■■■■■ 38.2
IGF2BP1Q9NZI8 LYRM4-204ENST00000463032 1487 ntTSL 1 (best)13.46□□□□□ -0.259e-12■■■■■ 38.2
IGF2BP1Q9NZI8 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.39e-12■■■■■ 38.2
IGF2BP1Q9NZI8 LYRM4-203ENST00000458438 941 ntTSL 212.61□□□□□ -0.399e-12■■■■■ 38.2
IGF2BP1Q9NZI8 LYRM4-205ENST00000464010 1401 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.479e-12■■■■■ 38.2
IGF2BP1Q9NZI8 PKP4-208ENST00000462335 561 ntTSL 49.55□□□□□ -0.889e-12■■■■■ 38.2
IGF2BP1Q9NZI8 SLC2A3-205ENST00000486749 4414 ntTSL 1 (best)8.64□□□□□ -1.034e-11■■■■■ 38.2
IGF2BP1Q9NZI8 LYRM4-201ENST00000330636 7312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.059e-12■■■■■ 38.2
IGF2BP1Q9NZI8 SLC2A3-201ENST00000075120 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.134e-11■■■■■ 38.2
IGF2BP1Q9NZI8 SLC2A3-202ENST00000469295 1030 ntTSL 27.27□□□□□ -1.254e-11■■■■■ 38.2
IGF2BP1Q9NZI8 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.642e-14■■■■■ 38.1
IGF2BP1Q9NZI8 LAMP1-203ENST00000472564 5242 ntTSL 217.4■□□□□ 0.382e-14■■■■■ 38.1
IGF2BP1Q9NZI8 PTPN12-202ENST00000407343 704 ntTSL 39.07□□□□□ -0.961e-8■■■■■ 37.9
IGF2BP1Q9NZI8 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.932e-8■■■■■ 37.9
IGF2BP1Q9NZI8 CABIN1-206ENST00000454754 1321 ntTSL 1 (best)19.73■□□□□ 0.752e-11■■■■■ 37.9
IGF2BP1Q9NZI8 CABIN1-205ENST00000445422 1472 ntTSL 219.14■□□□□ 0.652e-11■■■■■ 37.9
IGF2BP1Q9NZI8 KEL-208ENST00000479768 1856 ntTSL 513.55□□□□□ -0.242e-11■■■■■ 37.9
IGF2BP1Q9NZI8 CABIN1-201ENST00000263119 7222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.522e-11■■■■■ 37.9
IGF2BP1Q9NZI8 CABIN1-203ENST00000398319 7480 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.532e-11■■■■■ 37.9
IGF2BP1Q9NZI8 CABIN1-204ENST00000405822 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.592e-11■■■■■ 37.9
IGF2BP1Q9NZI8 CABIN1-214ENST00000617531 7072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.652e-11■■■■■ 37.9
IGF2BP1Q9NZI8 KEL-201ENST00000355265 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.932e-11■■■■■ 37.9
IGF2BP1Q9NZI8 HELLS-203ENST00000371327 4987 ntTSL 23.42□□□□□ -1.862e-11■■■■■ 37.9
IGF2BP1Q9NZI8 NDC1-202ENST00000480952 785 ntTSL 312.95□□□□□ -0.347e-9■■■■■ 37.9
IGF2BP1Q9NZI8 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.556e-11■■■■■ 37.8
IGF2BP1Q9NZI8 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.024e-9■■■■■ 37.8
Retrieved 100 of 17,531 protein–RNA pairs in 324.3 ms