Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY74

ETAA1, Ewing's tumor-associated antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETAA1Q9NY74 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ETAA1Q9NY74 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ETAA1Q9NY74 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ETAA1Q9NY74 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ETAA1Q9NY74 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ETAA1Q9NY74 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ETAA1Q9NY74 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ETAA1Q9NY74 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ETAA1Q9NY74 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ETAA1Q9NY74 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ETAA1Q9NY74 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ETAA1Q9NY74 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ETAA1Q9NY74 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ETAA1Q9NY74 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ETAA1Q9NY74 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ETAA1Q9NY74 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ETAA1Q9NY74 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ETAA1Q9NY74 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ETAA1Q9NY74 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ETAA1Q9NY74 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ETAA1Q9NY74 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ETAA1Q9NY74 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ETAA1Q9NY74 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ETAA1Q9NY74 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ETAA1Q9NY74 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ETAA1Q9NY74 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ETAA1Q9NY74 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ETAA1Q9NY74 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ETAA1Q9NY74 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ETAA1Q9NY74 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ETAA1Q9NY74 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ETAA1Q9NY74 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ETAA1Q9NY74 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ETAA1Q9NY74 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ETAA1Q9NY74 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ETAA1Q9NY74 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ETAA1Q9NY74 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ETAA1Q9NY74 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ETAA1Q9NY74 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ETAA1Q9NY74 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ETAA1Q9NY74 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ETAA1Q9NY74 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ETAA1Q9NY74 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ETAA1Q9NY74 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
ETAA1Q9NY74 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ETAA1Q9NY74 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ETAA1Q9NY74 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ETAA1Q9NY74 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ETAA1Q9NY74 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ETAA1Q9NY74 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ETAA1Q9NY74 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ETAA1Q9NY74 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ETAA1Q9NY74 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ETAA1Q9NY74 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ETAA1Q9NY74 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ETAA1Q9NY74 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ETAA1Q9NY74 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ETAA1Q9NY74 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ETAA1Q9NY74 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ETAA1Q9NY74 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ETAA1Q9NY74 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ETAA1Q9NY74 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ETAA1Q9NY74 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ETAA1Q9NY74 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ETAA1Q9NY74 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ETAA1Q9NY74 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ETAA1Q9NY74 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ETAA1Q9NY74 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ETAA1Q9NY74 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ETAA1Q9NY74 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ETAA1Q9NY74 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ETAA1Q9NY74 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ETAA1Q9NY74 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ETAA1Q9NY74 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ETAA1Q9NY74 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ETAA1Q9NY74 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ETAA1Q9NY74 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ETAA1Q9NY74 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ETAA1Q9NY74 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ETAA1Q9NY74 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ETAA1Q9NY74 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ETAA1Q9NY74 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ETAA1Q9NY74 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ETAA1Q9NY74 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ETAA1Q9NY74 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ETAA1Q9NY74 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ETAA1Q9NY74 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ETAA1Q9NY74 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ETAA1Q9NY74 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ETAA1Q9NY74 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ETAA1Q9NY74 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ETAA1Q9NY74 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ETAA1Q9NY74 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ETAA1Q9NY74 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ETAA1Q9NY74 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ETAA1Q9NY74 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ETAA1Q9NY74 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ETAA1Q9NY74 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ETAA1Q9NY74 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ETAA1Q9NY74 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms