Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG0

CNTLN, Centlein, humanhuman

Predictions only

Length 1,405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTLNQ9NXG0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC40.34■■■■■ 4.05
CNTLNQ9NXG0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
CNTLNQ9NXG0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC40.33■■■■■ 4.05
CNTLNQ9NXG0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC40.33■■■■■ 4.05
CNTLNQ9NXG0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.33■■■■■ 4.05
CNTLNQ9NXG0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
CNTLNQ9NXG0 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
CNTLNQ9NXG0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
CNTLNQ9NXG0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
CNTLNQ9NXG0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
CNTLNQ9NXG0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
CNTLNQ9NXG0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
CNTLNQ9NXG0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC40.28■■■■■ 4.04
CNTLNQ9NXG0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
CNTLNQ9NXG0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
CNTLNQ9NXG0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC40.27■■■■■ 4.04
CNTLNQ9NXG0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
CNTLNQ9NXG0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
CNTLNQ9NXG0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.26■■■■■ 4.04
CNTLNQ9NXG0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC40.25■■■■■ 4.03
CNTLNQ9NXG0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
CNTLNQ9NXG0 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
CNTLNQ9NXG0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC40.24■■■■■ 4.03
CNTLNQ9NXG0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
CNTLNQ9NXG0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
CNTLNQ9NXG0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC40.2■■■■■ 4.03
CNTLNQ9NXG0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
CNTLNQ9NXG0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC40.17■■■■■ 4.02
CNTLNQ9NXG0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC40.17■■■■■ 4.02
CNTLNQ9NXG0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
CNTLNQ9NXG0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
CNTLNQ9NXG0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC40.1■■■■■ 4.01
CNTLNQ9NXG0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC40.1■■■■■ 4.01
CNTLNQ9NXG0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
CNTLNQ9NXG0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC40.09■■■■■ 4.01
CNTLNQ9NXG0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
CNTLNQ9NXG0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.09■■■■■ 4.01
CNTLNQ9NXG0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
CNTLNQ9NXG0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
CNTLNQ9NXG0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
CNTLNQ9NXG0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC40.08■■■■■ 4.01
CNTLNQ9NXG0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
CNTLNQ9NXG0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
CNTLNQ9NXG0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
CNTLNQ9NXG0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC40.07■■■■■ 4
CNTLNQ9NXG0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
CNTLNQ9NXG0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
CNTLNQ9NXG0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
CNTLNQ9NXG0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
CNTLNQ9NXG0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.02■■■■■ 4
CNTLNQ9NXG0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC39.99■■■■□ 3.99
CNTLNQ9NXG0 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
CNTLNQ9NXG0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC39.98■■■■□ 3.99
CNTLNQ9NXG0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC39.97■■■■□ 3.99
CNTLNQ9NXG0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
CNTLNQ9NXG0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
CNTLNQ9NXG0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC39.95■■■■□ 3.99
CNTLNQ9NXG0 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
CNTLNQ9NXG0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.93■■■■□ 3.98
CNTLNQ9NXG0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC39.91■■■■□ 3.98
CNTLNQ9NXG0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC39.91■■■■□ 3.98
CNTLNQ9NXG0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
CNTLNQ9NXG0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC39.9■■■■□ 3.98
CNTLNQ9NXG0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.89■■■■□ 3.98
CNTLNQ9NXG0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC39.89■■■■□ 3.98
CNTLNQ9NXG0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC39.89■■■■□ 3.98
CNTLNQ9NXG0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC39.87■■■■□ 3.97
CNTLNQ9NXG0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC39.87■■■■□ 3.97
CNTLNQ9NXG0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC39.87■■■■□ 3.97
CNTLNQ9NXG0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC39.87■■■■□ 3.97
CNTLNQ9NXG0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC39.87■■■■□ 3.97
CNTLNQ9NXG0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC39.87■■■■□ 3.97
CNTLNQ9NXG0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC39.87■■■■□ 3.97
CNTLNQ9NXG0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC39.87■■■■□ 3.97
CNTLNQ9NXG0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC39.87■■■■□ 3.97
CNTLNQ9NXG0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.87■■■■□ 3.97
CNTLNQ9NXG0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC39.86■■■■□ 3.97
CNTLNQ9NXG0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
CNTLNQ9NXG0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC39.86■■■■□ 3.97
CNTLNQ9NXG0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
CNTLNQ9NXG0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
CNTLNQ9NXG0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC39.84■■■■□ 3.97
CNTLNQ9NXG0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
CNTLNQ9NXG0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
CNTLNQ9NXG0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
CNTLNQ9NXG0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
CNTLNQ9NXG0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC39.82■■■■□ 3.97
CNTLNQ9NXG0 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.96
CNTLNQ9NXG0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
CNTLNQ9NXG0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
CNTLNQ9NXG0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
CNTLNQ9NXG0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
CNTLNQ9NXG0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC39.8■■■■□ 3.96
CNTLNQ9NXG0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC39.78■■■■□ 3.96
CNTLNQ9NXG0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
CNTLNQ9NXG0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC39.77■■■■□ 3.96
CNTLNQ9NXG0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
CNTLNQ9NXG0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
CNTLNQ9NXG0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC39.76■■■■□ 3.96
CNTLNQ9NXG0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms