Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX78

TMEM260, Transmembrane protein 260, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM260Q9NX78 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
TMEM260Q9NX78 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
TMEM260Q9NX78 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
TMEM260Q9NX78 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
TMEM260Q9NX78 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
TMEM260Q9NX78 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
TMEM260Q9NX78 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
TMEM260Q9NX78 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
TMEM260Q9NX78 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
TMEM260Q9NX78 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
TMEM260Q9NX78 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
TMEM260Q9NX78 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
TMEM260Q9NX78 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
TMEM260Q9NX78 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
TMEM260Q9NX78 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
TMEM260Q9NX78 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
TMEM260Q9NX78 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
TMEM260Q9NX78 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TMEM260Q9NX78 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TMEM260Q9NX78 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
TMEM260Q9NX78 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TMEM260Q9NX78 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
TMEM260Q9NX78 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
TMEM260Q9NX78 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TMEM260Q9NX78 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TMEM260Q9NX78 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TMEM260Q9NX78 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
TMEM260Q9NX78 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
TMEM260Q9NX78 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
TMEM260Q9NX78 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
TMEM260Q9NX78 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
TMEM260Q9NX78 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
TMEM260Q9NX78 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
TMEM260Q9NX78 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TMEM260Q9NX78 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TMEM260Q9NX78 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TMEM260Q9NX78 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
TMEM260Q9NX78 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
TMEM260Q9NX78 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
TMEM260Q9NX78 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
TMEM260Q9NX78 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
TMEM260Q9NX78 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC30.45■■■□□ 2.46
TMEM260Q9NX78 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
TMEM260Q9NX78 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
TMEM260Q9NX78 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
TMEM260Q9NX78 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC30.43■■■□□ 2.46
TMEM260Q9NX78 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
TMEM260Q9NX78 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TMEM260Q9NX78 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
TMEM260Q9NX78 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
TMEM260Q9NX78 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
TMEM260Q9NX78 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
TMEM260Q9NX78 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
TMEM260Q9NX78 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
TMEM260Q9NX78 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
TMEM260Q9NX78 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
TMEM260Q9NX78 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
TMEM260Q9NX78 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TMEM260Q9NX78 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TMEM260Q9NX78 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TMEM260Q9NX78 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TMEM260Q9NX78 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TMEM260Q9NX78 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TMEM260Q9NX78 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TMEM260Q9NX78 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
TMEM260Q9NX78 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
TMEM260Q9NX78 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
TMEM260Q9NX78 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
TMEM260Q9NX78 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
TMEM260Q9NX78 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
TMEM260Q9NX78 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
TMEM260Q9NX78 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TMEM260Q9NX78 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
TMEM260Q9NX78 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
TMEM260Q9NX78 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TMEM260Q9NX78 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
TMEM260Q9NX78 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
TMEM260Q9NX78 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TMEM260Q9NX78 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TMEM260Q9NX78 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TMEM260Q9NX78 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
TMEM260Q9NX78 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
TMEM260Q9NX78 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
TMEM260Q9NX78 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
TMEM260Q9NX78 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TMEM260Q9NX78 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TMEM260Q9NX78 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TMEM260Q9NX78 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
TMEM260Q9NX78 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
TMEM260Q9NX78 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TMEM260Q9NX78 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TMEM260Q9NX78 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TMEM260Q9NX78 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
TMEM260Q9NX78 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
TMEM260Q9NX78 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
TMEM260Q9NX78 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TMEM260Q9NX78 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TMEM260Q9NX78 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TMEM260Q9NX78 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TMEM260Q9NX78 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 203.6 ms