Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX57

RAB20, Ras-related protein Rab-20, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB20Q9NX57 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RAB20Q9NX57 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RAB20Q9NX57 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RAB20Q9NX57 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RAB20Q9NX57 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RAB20Q9NX57 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RAB20Q9NX57 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
RAB20Q9NX57 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RAB20Q9NX57 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RAB20Q9NX57 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RAB20Q9NX57 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RAB20Q9NX57 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RAB20Q9NX57 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RAB20Q9NX57 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RAB20Q9NX57 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RAB20Q9NX57 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RAB20Q9NX57 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RAB20Q9NX57 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RAB20Q9NX57 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RAB20Q9NX57 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RAB20Q9NX57 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RAB20Q9NX57 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RAB20Q9NX57 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RAB20Q9NX57 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RAB20Q9NX57 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RAB20Q9NX57 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
RAB20Q9NX57 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RAB20Q9NX57 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
RAB20Q9NX57 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RAB20Q9NX57 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RAB20Q9NX57 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RAB20Q9NX57 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
RAB20Q9NX57 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RAB20Q9NX57 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RAB20Q9NX57 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RAB20Q9NX57 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RAB20Q9NX57 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RAB20Q9NX57 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
RAB20Q9NX57 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
RAB20Q9NX57 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
RAB20Q9NX57 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RAB20Q9NX57 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RAB20Q9NX57 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RAB20Q9NX57 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
RAB20Q9NX57 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RAB20Q9NX57 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RAB20Q9NX57 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RAB20Q9NX57 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RAB20Q9NX57 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RAB20Q9NX57 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RAB20Q9NX57 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RAB20Q9NX57 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RAB20Q9NX57 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RAB20Q9NX57 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RAB20Q9NX57 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RAB20Q9NX57 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RAB20Q9NX57 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RAB20Q9NX57 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RAB20Q9NX57 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RAB20Q9NX57 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
RAB20Q9NX57 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RAB20Q9NX57 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RAB20Q9NX57 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RAB20Q9NX57 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RAB20Q9NX57 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RAB20Q9NX57 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RAB20Q9NX57 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RAB20Q9NX57 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RAB20Q9NX57 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RAB20Q9NX57 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RAB20Q9NX57 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RAB20Q9NX57 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RAB20Q9NX57 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
RAB20Q9NX57 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RAB20Q9NX57 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RAB20Q9NX57 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RAB20Q9NX57 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RAB20Q9NX57 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RAB20Q9NX57 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RAB20Q9NX57 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RAB20Q9NX57 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RAB20Q9NX57 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RAB20Q9NX57 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RAB20Q9NX57 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RAB20Q9NX57 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
RAB20Q9NX57 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RAB20Q9NX57 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RAB20Q9NX57 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RAB20Q9NX57 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RAB20Q9NX57 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RAB20Q9NX57 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RAB20Q9NX57 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
RAB20Q9NX57 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RAB20Q9NX57 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RAB20Q9NX57 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RAB20Q9NX57 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RAB20Q9NX57 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RAB20Q9NX57 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RAB20Q9NX57 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAB20Q9NX57 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms