Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RHBDL2Q9NX52 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RHBDL2Q9NX52 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHBDL2Q9NX52 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHBDL2Q9NX52 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHBDL2Q9NX52 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHBDL2Q9NX52 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHBDL2Q9NX52 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RHBDL2Q9NX52 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RHBDL2Q9NX52 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RHBDL2Q9NX52 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHBDL2Q9NX52 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHBDL2Q9NX52 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHBDL2Q9NX52 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHBDL2Q9NX52 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHBDL2Q9NX52 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHBDL2Q9NX52 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHBDL2Q9NX52 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHBDL2Q9NX52 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RHBDL2Q9NX52 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RHBDL2Q9NX52 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RHBDL2Q9NX52 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHBDL2Q9NX52 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHBDL2Q9NX52 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHBDL2Q9NX52 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RHBDL2Q9NX52 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHBDL2Q9NX52 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHBDL2Q9NX52 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RHBDL2Q9NX52 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RHBDL2Q9NX52 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHBDL2Q9NX52 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHBDL2Q9NX52 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHBDL2Q9NX52 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RHBDL2Q9NX52 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RHBDL2Q9NX52 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RHBDL2Q9NX52 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RHBDL2Q9NX52 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RHBDL2Q9NX52 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RHBDL2Q9NX52 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RHBDL2Q9NX52 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RHBDL2Q9NX52 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RHBDL2Q9NX52 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHBDL2Q9NX52 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHBDL2Q9NX52 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHBDL2Q9NX52 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHBDL2Q9NX52 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHBDL2Q9NX52 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RHBDL2Q9NX52 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RHBDL2Q9NX52 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RHBDL2Q9NX52 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RHBDL2Q9NX52 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RHBDL2Q9NX52 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RHBDL2Q9NX52 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RHBDL2Q9NX52 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RHBDL2Q9NX52 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RHBDL2Q9NX52 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RHBDL2Q9NX52 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RHBDL2Q9NX52 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RHBDL2Q9NX52 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RHBDL2Q9NX52 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RHBDL2Q9NX52 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RHBDL2Q9NX52 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RHBDL2Q9NX52 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RHBDL2Q9NX52 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RHBDL2Q9NX52 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RHBDL2Q9NX52 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RHBDL2Q9NX52 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RHBDL2Q9NX52 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RHBDL2Q9NX52 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RHBDL2Q9NX52 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RHBDL2Q9NX52 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RHBDL2Q9NX52 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RHBDL2Q9NX52 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RHBDL2Q9NX52 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RHBDL2Q9NX52 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RHBDL2Q9NX52 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RHBDL2Q9NX52 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RHBDL2Q9NX52 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RHBDL2Q9NX52 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RHBDL2Q9NX52 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RHBDL2Q9NX52 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RHBDL2Q9NX52 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RHBDL2Q9NX52 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RHBDL2Q9NX52 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RHBDL2Q9NX52 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RHBDL2Q9NX52 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RHBDL2Q9NX52 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHBDL2Q9NX52 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHBDL2Q9NX52 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHBDL2Q9NX52 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHBDL2Q9NX52 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHBDL2Q9NX52 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RHBDL2Q9NX52 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHBDL2Q9NX52 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RHBDL2Q9NX52 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHBDL2Q9NX52 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHBDL2Q9NX52 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHBDL2Q9NX52 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHBDL2Q9NX52 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHBDL2Q9NX52 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms