Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWY4

HPF1, Histone PARylation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPF1Q9NWY4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HPF1Q9NWY4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HPF1Q9NWY4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HPF1Q9NWY4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HPF1Q9NWY4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HPF1Q9NWY4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HPF1Q9NWY4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HPF1Q9NWY4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HPF1Q9NWY4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HPF1Q9NWY4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HPF1Q9NWY4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HPF1Q9NWY4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HPF1Q9NWY4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HPF1Q9NWY4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HPF1Q9NWY4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HPF1Q9NWY4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HPF1Q9NWY4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HPF1Q9NWY4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HPF1Q9NWY4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HPF1Q9NWY4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HPF1Q9NWY4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HPF1Q9NWY4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HPF1Q9NWY4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HPF1Q9NWY4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HPF1Q9NWY4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HPF1Q9NWY4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HPF1Q9NWY4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HPF1Q9NWY4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HPF1Q9NWY4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HPF1Q9NWY4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HPF1Q9NWY4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HPF1Q9NWY4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HPF1Q9NWY4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HPF1Q9NWY4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HPF1Q9NWY4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HPF1Q9NWY4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HPF1Q9NWY4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HPF1Q9NWY4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HPF1Q9NWY4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HPF1Q9NWY4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HPF1Q9NWY4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HPF1Q9NWY4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HPF1Q9NWY4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HPF1Q9NWY4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HPF1Q9NWY4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HPF1Q9NWY4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HPF1Q9NWY4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HPF1Q9NWY4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HPF1Q9NWY4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HPF1Q9NWY4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HPF1Q9NWY4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HPF1Q9NWY4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HPF1Q9NWY4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HPF1Q9NWY4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HPF1Q9NWY4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HPF1Q9NWY4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HPF1Q9NWY4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HPF1Q9NWY4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HPF1Q9NWY4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HPF1Q9NWY4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
HPF1Q9NWY4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HPF1Q9NWY4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HPF1Q9NWY4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HPF1Q9NWY4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HPF1Q9NWY4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HPF1Q9NWY4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HPF1Q9NWY4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HPF1Q9NWY4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HPF1Q9NWY4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HPF1Q9NWY4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HPF1Q9NWY4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HPF1Q9NWY4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HPF1Q9NWY4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
HPF1Q9NWY4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HPF1Q9NWY4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HPF1Q9NWY4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HPF1Q9NWY4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HPF1Q9NWY4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HPF1Q9NWY4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HPF1Q9NWY4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HPF1Q9NWY4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HPF1Q9NWY4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HPF1Q9NWY4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HPF1Q9NWY4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HPF1Q9NWY4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HPF1Q9NWY4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HPF1Q9NWY4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HPF1Q9NWY4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HPF1Q9NWY4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HPF1Q9NWY4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HPF1Q9NWY4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
HPF1Q9NWY4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HPF1Q9NWY4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HPF1Q9NWY4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HPF1Q9NWY4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HPF1Q9NWY4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HPF1Q9NWY4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HPF1Q9NWY4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HPF1Q9NWY4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HPF1Q9NWY4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 168.4 ms