Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWH7

SPATA6, Spermatogenesis-associated protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA6Q9NWH7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SPATA6Q9NWH7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SPATA6Q9NWH7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SPATA6Q9NWH7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SPATA6Q9NWH7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SPATA6Q9NWH7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPATA6Q9NWH7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPATA6Q9NWH7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SPATA6Q9NWH7 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPATA6Q9NWH7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPATA6Q9NWH7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SPATA6Q9NWH7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SPATA6Q9NWH7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SPATA6Q9NWH7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SPATA6Q9NWH7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SPATA6Q9NWH7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SPATA6Q9NWH7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SPATA6Q9NWH7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SPATA6Q9NWH7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SPATA6Q9NWH7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SPATA6Q9NWH7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SPATA6Q9NWH7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SPATA6Q9NWH7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SPATA6Q9NWH7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SPATA6Q9NWH7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SPATA6Q9NWH7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SPATA6Q9NWH7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SPATA6Q9NWH7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SPATA6Q9NWH7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SPATA6Q9NWH7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SPATA6Q9NWH7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SPATA6Q9NWH7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SPATA6Q9NWH7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPATA6Q9NWH7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPATA6Q9NWH7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPATA6Q9NWH7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPATA6Q9NWH7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SPATA6Q9NWH7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SPATA6Q9NWH7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SPATA6Q9NWH7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SPATA6Q9NWH7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPATA6Q9NWH7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPATA6Q9NWH7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPATA6Q9NWH7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPATA6Q9NWH7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPATA6Q9NWH7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPATA6Q9NWH7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPATA6Q9NWH7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPATA6Q9NWH7 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPATA6Q9NWH7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPATA6Q9NWH7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPATA6Q9NWH7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SPATA6Q9NWH7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SPATA6Q9NWH7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SPATA6Q9NWH7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SPATA6Q9NWH7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SPATA6Q9NWH7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
SPATA6Q9NWH7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SPATA6Q9NWH7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SPATA6Q9NWH7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SPATA6Q9NWH7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SPATA6Q9NWH7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SPATA6Q9NWH7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPATA6Q9NWH7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPATA6Q9NWH7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPATA6Q9NWH7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPATA6Q9NWH7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPATA6Q9NWH7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPATA6Q9NWH7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPATA6Q9NWH7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SPATA6Q9NWH7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SPATA6Q9NWH7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SPATA6Q9NWH7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SPATA6Q9NWH7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SPATA6Q9NWH7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPATA6Q9NWH7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPATA6Q9NWH7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPATA6Q9NWH7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPATA6Q9NWH7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPATA6Q9NWH7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPATA6Q9NWH7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SPATA6Q9NWH7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SPATA6Q9NWH7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SPATA6Q9NWH7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPATA6Q9NWH7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPATA6Q9NWH7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPATA6Q9NWH7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPATA6Q9NWH7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPATA6Q9NWH7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPATA6Q9NWH7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPATA6Q9NWH7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPATA6Q9NWH7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPATA6Q9NWH7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPATA6Q9NWH7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SPATA6Q9NWH7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SPATA6Q9NWH7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SPATA6Q9NWH7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SPATA6Q9NWH7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SPATA6Q9NWH7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SPATA6Q9NWH7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms