Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ASF1BQ9NVP2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ASF1BQ9NVP2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ASF1BQ9NVP2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ASF1BQ9NVP2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ASF1BQ9NVP2 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ASF1BQ9NVP2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ASF1BQ9NVP2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ASF1BQ9NVP2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ASF1BQ9NVP2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ASF1BQ9NVP2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ASF1BQ9NVP2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ASF1BQ9NVP2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ASF1BQ9NVP2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ASF1BQ9NVP2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ASF1BQ9NVP2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ASF1BQ9NVP2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ASF1BQ9NVP2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ASF1BQ9NVP2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ASF1BQ9NVP2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ASF1BQ9NVP2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ASF1BQ9NVP2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ASF1BQ9NVP2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ASF1BQ9NVP2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ASF1BQ9NVP2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ASF1BQ9NVP2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ASF1BQ9NVP2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ASF1BQ9NVP2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ASF1BQ9NVP2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ASF1BQ9NVP2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ASF1BQ9NVP2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ASF1BQ9NVP2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ASF1BQ9NVP2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ASF1BQ9NVP2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ASF1BQ9NVP2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ASF1BQ9NVP2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ASF1BQ9NVP2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ASF1BQ9NVP2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ASF1BQ9NVP2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ASF1BQ9NVP2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ASF1BQ9NVP2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ASF1BQ9NVP2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ASF1BQ9NVP2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ASF1BQ9NVP2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ASF1BQ9NVP2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ASF1BQ9NVP2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ASF1BQ9NVP2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ASF1BQ9NVP2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ASF1BQ9NVP2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ASF1BQ9NVP2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ASF1BQ9NVP2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ASF1BQ9NVP2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ASF1BQ9NVP2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ASF1BQ9NVP2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ASF1BQ9NVP2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ASF1BQ9NVP2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ASF1BQ9NVP2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ASF1BQ9NVP2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ASF1BQ9NVP2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ASF1BQ9NVP2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ASF1BQ9NVP2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ASF1BQ9NVP2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ASF1BQ9NVP2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ASF1BQ9NVP2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ASF1BQ9NVP2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ASF1BQ9NVP2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ASF1BQ9NVP2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ASF1BQ9NVP2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ASF1BQ9NVP2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ASF1BQ9NVP2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ASF1BQ9NVP2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ASF1BQ9NVP2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ASF1BQ9NVP2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ASF1BQ9NVP2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ASF1BQ9NVP2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ASF1BQ9NVP2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ASF1BQ9NVP2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ASF1BQ9NVP2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ASF1BQ9NVP2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ASF1BQ9NVP2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ASF1BQ9NVP2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ASF1BQ9NVP2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ASF1BQ9NVP2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ASF1BQ9NVP2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ASF1BQ9NVP2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ASF1BQ9NVP2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ASF1BQ9NVP2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ASF1BQ9NVP2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ASF1BQ9NVP2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ASF1BQ9NVP2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ASF1BQ9NVP2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ASF1BQ9NVP2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ASF1BQ9NVP2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ASF1BQ9NVP2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ASF1BQ9NVP2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ASF1BQ9NVP2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ASF1BQ9NVP2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ASF1BQ9NVP2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ASF1BQ9NVP2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ASF1BQ9NVP2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms