Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
TDP1Q9NUW8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TDP1Q9NUW8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TDP1Q9NUW8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TDP1Q9NUW8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TDP1Q9NUW8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
TDP1Q9NUW8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TDP1Q9NUW8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TDP1Q9NUW8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TDP1Q9NUW8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
TDP1Q9NUW8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TDP1Q9NUW8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TDP1Q9NUW8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TDP1Q9NUW8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TDP1Q9NUW8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TDP1Q9NUW8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TDP1Q9NUW8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TDP1Q9NUW8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TDP1Q9NUW8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TDP1Q9NUW8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TDP1Q9NUW8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TDP1Q9NUW8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TDP1Q9NUW8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TDP1Q9NUW8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
TDP1Q9NUW8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
TDP1Q9NUW8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TDP1Q9NUW8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TDP1Q9NUW8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TDP1Q9NUW8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TDP1Q9NUW8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TDP1Q9NUW8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TDP1Q9NUW8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TDP1Q9NUW8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TDP1Q9NUW8 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TDP1Q9NUW8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TDP1Q9NUW8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TDP1Q9NUW8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TDP1Q9NUW8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TDP1Q9NUW8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TDP1Q9NUW8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TDP1Q9NUW8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TDP1Q9NUW8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TDP1Q9NUW8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TDP1Q9NUW8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TDP1Q9NUW8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TDP1Q9NUW8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TDP1Q9NUW8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TDP1Q9NUW8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TDP1Q9NUW8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TDP1Q9NUW8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TDP1Q9NUW8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TDP1Q9NUW8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TDP1Q9NUW8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TDP1Q9NUW8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TDP1Q9NUW8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TDP1Q9NUW8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TDP1Q9NUW8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TDP1Q9NUW8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TDP1Q9NUW8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TDP1Q9NUW8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TDP1Q9NUW8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TDP1Q9NUW8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TDP1Q9NUW8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TDP1Q9NUW8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TDP1Q9NUW8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TDP1Q9NUW8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TDP1Q9NUW8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TDP1Q9NUW8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TDP1Q9NUW8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
TDP1Q9NUW8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TDP1Q9NUW8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TDP1Q9NUW8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TDP1Q9NUW8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TDP1Q9NUW8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TDP1Q9NUW8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TDP1Q9NUW8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TDP1Q9NUW8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TDP1Q9NUW8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TDP1Q9NUW8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TDP1Q9NUW8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TDP1Q9NUW8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TDP1Q9NUW8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TDP1Q9NUW8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TDP1Q9NUW8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TDP1Q9NUW8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TDP1Q9NUW8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TDP1Q9NUW8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TDP1Q9NUW8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TDP1Q9NUW8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TDP1Q9NUW8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TDP1Q9NUW8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TDP1Q9NUW8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TDP1Q9NUW8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TDP1Q9NUW8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TDP1Q9NUW8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TDP1Q9NUW8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TDP1Q9NUW8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TDP1Q9NUW8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TDP1Q9NUW8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TDP1Q9NUW8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 379.9 ms