Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPMQ9NSP4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPMQ9NSP4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPMQ9NSP4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPMQ9NSP4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPMQ9NSP4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPMQ9NSP4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPMQ9NSP4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPMQ9NSP4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPMQ9NSP4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPMQ9NSP4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPMQ9NSP4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPMQ9NSP4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPMQ9NSP4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPMQ9NSP4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPMQ9NSP4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPMQ9NSP4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPMQ9NSP4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPMQ9NSP4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPMQ9NSP4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPMQ9NSP4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPMQ9NSP4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPMQ9NSP4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPMQ9NSP4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPMQ9NSP4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPMQ9NSP4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPMQ9NSP4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPMQ9NSP4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPMQ9NSP4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPMQ9NSP4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPMQ9NSP4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CENPMQ9NSP4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CENPMQ9NSP4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPMQ9NSP4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPMQ9NSP4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPMQ9NSP4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPMQ9NSP4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPMQ9NSP4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPMQ9NSP4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPMQ9NSP4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPMQ9NSP4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPMQ9NSP4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPMQ9NSP4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPMQ9NSP4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPMQ9NSP4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPMQ9NSP4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPMQ9NSP4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPMQ9NSP4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CENPMQ9NSP4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CENPMQ9NSP4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CENPMQ9NSP4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CENPMQ9NSP4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPMQ9NSP4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPMQ9NSP4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPMQ9NSP4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPMQ9NSP4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPMQ9NSP4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPMQ9NSP4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPMQ9NSP4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPMQ9NSP4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPMQ9NSP4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPMQ9NSP4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPMQ9NSP4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPMQ9NSP4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPMQ9NSP4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPMQ9NSP4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPMQ9NSP4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPMQ9NSP4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPMQ9NSP4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPMQ9NSP4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPMQ9NSP4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPMQ9NSP4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPMQ9NSP4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPMQ9NSP4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPMQ9NSP4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPMQ9NSP4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPMQ9NSP4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPMQ9NSP4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPMQ9NSP4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPMQ9NSP4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPMQ9NSP4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPMQ9NSP4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPMQ9NSP4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPMQ9NSP4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPMQ9NSP4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPMQ9NSP4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPMQ9NSP4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPMQ9NSP4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPMQ9NSP4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPMQ9NSP4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPMQ9NSP4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPMQ9NSP4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPMQ9NSP4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPMQ9NSP4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPMQ9NSP4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPMQ9NSP4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPMQ9NSP4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPMQ9NSP4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPMQ9NSP4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPMQ9NSP4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms