Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HOMER3Q9NSC5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HOMER3Q9NSC5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HOMER3Q9NSC5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HOMER3Q9NSC5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HOMER3Q9NSC5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
HOMER3Q9NSC5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HOMER3Q9NSC5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HOMER3Q9NSC5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
HOMER3Q9NSC5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HOMER3Q9NSC5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HOMER3Q9NSC5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HOMER3Q9NSC5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HOMER3Q9NSC5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HOMER3Q9NSC5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HOMER3Q9NSC5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HOMER3Q9NSC5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HOMER3Q9NSC5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HOMER3Q9NSC5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HOMER3Q9NSC5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HOMER3Q9NSC5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
HOMER3Q9NSC5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HOMER3Q9NSC5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
HOMER3Q9NSC5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HOMER3Q9NSC5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HOMER3Q9NSC5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
HOMER3Q9NSC5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HOMER3Q9NSC5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
HOMER3Q9NSC5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HOMER3Q9NSC5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
HOMER3Q9NSC5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
HOMER3Q9NSC5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
HOMER3Q9NSC5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
HOMER3Q9NSC5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HOMER3Q9NSC5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
HOMER3Q9NSC5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HOMER3Q9NSC5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HOMER3Q9NSC5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HOMER3Q9NSC5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
HOMER3Q9NSC5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HOMER3Q9NSC5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HOMER3Q9NSC5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HOMER3Q9NSC5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HOMER3Q9NSC5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HOMER3Q9NSC5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HOMER3Q9NSC5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HOMER3Q9NSC5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HOMER3Q9NSC5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HOMER3Q9NSC5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HOMER3Q9NSC5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HOMER3Q9NSC5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HOMER3Q9NSC5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HOMER3Q9NSC5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HOMER3Q9NSC5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HOMER3Q9NSC5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HOMER3Q9NSC5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HOMER3Q9NSC5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HOMER3Q9NSC5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HOMER3Q9NSC5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HOMER3Q9NSC5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HOMER3Q9NSC5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HOMER3Q9NSC5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HOMER3Q9NSC5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HOMER3Q9NSC5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HOMER3Q9NSC5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
HOMER3Q9NSC5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HOMER3Q9NSC5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HOMER3Q9NSC5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HOMER3Q9NSC5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HOMER3Q9NSC5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HOMER3Q9NSC5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HOMER3Q9NSC5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
HOMER3Q9NSC5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HOMER3Q9NSC5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HOMER3Q9NSC5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HOMER3Q9NSC5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HOMER3Q9NSC5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HOMER3Q9NSC5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HOMER3Q9NSC5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HOMER3Q9NSC5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HOMER3Q9NSC5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
HOMER3Q9NSC5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HOMER3Q9NSC5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HOMER3Q9NSC5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HOMER3Q9NSC5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HOMER3Q9NSC5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HOMER3Q9NSC5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HOMER3Q9NSC5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HOMER3Q9NSC5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HOMER3Q9NSC5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HOMER3Q9NSC5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HOMER3Q9NSC5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HOMER3Q9NSC5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HOMER3Q9NSC5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HOMER3Q9NSC5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HOMER3Q9NSC5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HOMER3Q9NSC5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HOMER3Q9NSC5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HOMER3Q9NSC5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HOMER3Q9NSC5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms